atrophin 1

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同義遺伝子名

ATN1, DRPLA, NOD, B37, Dentatorubral-pallidoluysian atrophy protein, atrophin 1, Atrophin-1, D12S755E

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:51

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:148.30

末梢神経:122.70

脊柱:224.60

網膜:237.30

目:193.90

動脈:-

静脈:-

リンパ節:80.90

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:39.40

脂肪:-

骨:38.40

皮膚:76.80

GeneChip

大脳:5.64

小脳:6.03

脳幹:5.58

脳梁:5.49

松果体:-

末梢神経:5.45

脊柱:5.43

網膜:-

目:-

動脈:5.97

静脈:5.62

リンパ節:5.46

末梢血:-

脾臓:5.34

胸腺:5.24

骨髄:5.47

脂肪:6.08

骨:-

皮膚:5.36

CAGE

大脳:4.67

小脳:-

脳幹:4.25

脳梁:4.41

松果体:4.86

末梢神経:-

脊柱:4.82

網膜:-

目:-

動脈:4.56

静脈:3.60

リンパ節:3.33

末梢血:-

脾臓:3.42

胸腺:2.11

骨髄:-

脂肪:4.02

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:5.04

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:5.09

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:5.63

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:40.10

前立腺:33.80

卵巣:149.10

精巣:38.90

心臓:25.50

骨格筋:20.10

食道:-

胃:21.20

腸:-

結腸:186.60

肝臓:-

肺:34.20

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:116

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:53.30

乳腺:92.90

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.61

胎盤:5.39

前立腺:5.35

卵巣:5.57

精巣:5

心臓:5.26

骨格筋:5.41

食道:5.20

胃:5.33

腸:5.41

結腸:5.46

肝臓:5.16

肺:5.67

膀胱:-

腎臓:5.51

下垂体:6.48

甲状腺:5.59

副腎:5.71

膵臓:5.68

乳腺:5.65

唾液腺:5.44

CAGE

子宮:4.67

胎盤:3.86

前立腺:4.46

卵巣:4.79

精巣:3.57

心臓:4.24

骨格筋:3.53

食道:3.94

胃:-

腸:3.74

結腸:4.30

肝臓:2.46

肺:4.11

膀胱:4.51

腎臓:3.73

下垂体:4.54

甲状腺:4.13

副腎:-

膵臓:3.37

乳腺:4.41

唾液腺:4.26

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:5.63

卵巣:6.10

精巣:4.78

心臓:4.09

骨格筋:5.02

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:5.67

肝臓:2.09

肺:5.55

膀胱:-

腎臓:4.24

下垂体:-

甲状腺:4.90

副腎:4.72

膵臓:-

乳腺:4.99

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001940
Gene ID	1822
Unigene ID	Hs.143766
Probe set ID	208871_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000111676
GTEx ID	ENSG00000111676

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_007881
ラット [0]

染色体

12p13.31 [7,033,626 - 7,051,484]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR017993	Atrophin-1
IPR002951	Atrophin-like

GO:0016477	cell migration
GO:0007417	central nervous system development
GO:0030011	maintenance of cell polarity
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0051402	neuron apoptosis
GO:0009404	toxin metabolic process
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

GO:0030054	cell junction
GO:0005737	cytoplasm
GO:0016363	nuclear matrix
GO:0005634	nucleus
GO:0048471	perinuclear region of cytoplasm

GO:0005515	protein binding
GO:0019904	protein domain specific binding
GO:0050827	toxin receptor binding
GO:0003714	transcription corepressor activity

atrophin 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function