apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3F

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同義遺伝子名

MGC74891, BK150C2.4.MRNA, APOBEC3F, KA6, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, ARP8

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:4.02

小脳:3.86

脳幹:4.08

脳梁:3.89

松果体:-

末梢神経:4.34

脊柱:4.11

網膜:-

目:-

動脈:4.15

静脈:4.17

リンパ節:4.59

末梢血:-

脾臓:5.12

胸腺:4.94

骨髄:4.40

脂肪:4.37

骨:-

皮膚:4.28

CAGE

大脳:0.37

小脳:-

脳幹:0.55

脳梁:1.01

松果体:0.79

末梢神経:-

脊柱:0.79

網膜:-

目:-

動脈:1.10

静脈:1.61

リンパ節:1.75

末梢血:-

脾臓:2.06

胸腺:1.35

骨髄:-

脂肪:1.47

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.00

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.98

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.44

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:4.73

胎盤:3.99

前立腺:4.79

卵巣:4.88

精巣:5.26

心臓:4.18

骨格筋:4.07

食道:4.28

胃:4.30

腸:4.23

結腸:4.43

肝臓:4.23

肺:4.18

膀胱:-

腎臓:4.07

下垂体:4.39

甲状腺:4.31

副腎:4.53

膵臓:4.19

乳腺:4.24

唾液腺:4.25

CAGE

子宮:1.69

胎盤:0.48

前立腺:1.38

卵巣:2.07

精巣:1.89

心臓:0.86

骨格筋:0.45

食道:1.26

胃:-

腸:0.43

結腸:0.97

肝臓:1.07

肺:1.45

膀胱:1.21

腎臓:1.30

下垂体:0.95

甲状腺:0.95

副腎:-

膵臓:1.21

乳腺:0

唾液腺:1.39

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.66

卵巣:1.44

精巣:1.33

心臓:0.63

骨格筋:0.17

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.89

肝臓:0.08

肺:0.56

膀胱:-

腎臓:0.77

下垂体:-

甲状腺:0.69

副腎:0.96

膵臓:-

乳腺:0.64

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001006666
Gene ID	200316
Unigene ID	-
Probe set ID	214995_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000128394
GTEx ID	ENSG00000128394

オーソログ対応遺伝子

マウス [0]
ラット [0]

染色体

22q13.1 [39,436,609 - 39,449,915]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0016553	base conversion or substitution editing
GO:0009972	cytidine deamination
GO:0051607	defense response to virus
GO:0070383	DNA cytosine deamination
GO:0080111	DNA demethylation
GO:0045087	innate immune response
GO:0045869	negative regulation of retroviral genome replication
GO:0010529	negative regulation of transposition
GO:0045071	negative regulation of viral genome replication
GO:0048525	negative regulation of viral reproduction
GO:0002230	positive regulation of defense response to virus by host

Cellular Component

GO:0030895	apolipoprotein B mRNA editing enzyme complex
GO:0005737	cytoplasm
GO:0000932	cytoplasmic mRNA processing body
GO:0030529	ribonucleoprotein complex

Molecular Function

GO:0004126	cytidine deaminase activity
GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding
GO:0008270	zinc ion binding

apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3F

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function