KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 2

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同義遺伝子名

SLM1, KHDRBS2, MGC26664, bA535F17.1, SLM-1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:56.90 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:237.30 目:41.10 動脈:- 静脈:- リンパ節:10.10 末梢血:- 脾臓:18.90 胸腺:12.90 骨髄:19.70 脂肪:- 骨:- 皮膚:4.80
GeneChip 大脳:5.66 小脳:4.95 脳幹:5.40 脳梁:5.37 松果体:- 末梢神経:4.86 脊柱:4.93 網膜:- 目:- 動脈:4.87 静脈:5.03 リンパ節:4.80 末梢血:- 脾臓:4.85 胸腺:4.51 骨髄:4.93 脂肪:4.99 骨:- 皮膚:5.08
CAGE 大脳:2.91 小脳:- 脳幹:2.07 脳梁:1.99 松果体:3.35 末梢神経:- 脊柱:1.87 網膜:- 目:- 動脈:0.59 静脈:2.25 リンパ節:1.79 末梢血:- 脾臓:2.29 胸腺:0.99 骨髄:- 脂肪:0.63 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.80 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.29 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.03 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:21.60 心臓:25.50 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:24.40    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:163.70 副腎:- 膵臓:8.90 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.57 胎盤:4.58 前立腺:4.33 卵巣:4.52 精巣:4.51 心臓:5.18 骨格筋:5.36 食道:4.79 胃:4.99 腸:4.98 結腸:4.90 肝臓:4.89 肺:5.09 膀胱:- 腎臓:4.89 下垂体:5.05 甲状腺:5.35 副腎:5 膵臓:5.57 乳腺:4.68 唾液腺:4.74
CAGE 子宮:0.92 胎盤:0.92 前立腺:1.00 卵巣:0.47 精巣:1.15 心臓:0.38 骨格筋:0.38 食道:0.73 胃:- 腸:0.96 結腸:1.75     肝臓:0    肺:3.00 膀胱:1.27 腎臓:1.14 下垂体:2.92 甲状腺:2.40 副腎:- 膵臓:0 乳腺:0.55 唾液腺:1.39
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.15 卵巣:0.02 精巣:0.04 心臓:0.04 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.04     肝臓:0        肺:1.32    膀胱:- 腎臓:0.11 下垂体:- 甲状腺:1.33 副腎:0.38 膵臓:- 乳腺:0.01 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_152688
Gene ID 202559
Unigene ID Hs.519794
Probe set ID 215527_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000112232
GTEx ID ENSG00000112232

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_133235
ラット[1]  NM_133318

染色体

6q11.1  [62,390,139  -  62,996,132]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR004087  K Homology
IPR004088  K Homology, type 1

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10077576
12477932
12529443
12549823
14702039
15345239
16189514
17207965
17643375
18029348
18464913
19091369
19254361
19282290
21890473
21906983
22505724
23000965
23503679
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0008143  poly(A) RNA binding
GO:0008266  poly(U) RNA binding
GO:0005515  protein binding
GO:0046982  protein heterodimerization activity
GO:0042169  SH2 domain binding
GO:0017124  SH3 domain binding