excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 5

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同義遺伝子名

XPGC, ERCM2, ERCC5, UVDR, DNA excision repair protein ERCC-5, XPG, DNA-repair protein complementing XP-G cells

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:75.80

小脳:88.20

脳幹:-

脳梁:87.50

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:118.60

目:88.20

動脈:30

静脈:-

リンパ節:141.50

末梢血:18.20

脾臓:132.30

胸腺:128.80

骨髄:39.40

脂肪:40.30

骨:115.20

皮膚:43.20

GeneChip

大脳:5.99

小脳:5.79

脳幹:6.19

脳梁:6.05

松果体:-

末梢神経:6.25

脊柱:5.66

網膜:-

目:-

動脈:6.72

静脈:6.01

リンパ節:7.01

末梢血:-

脾臓:6.89

胸腺:7.41

骨髄:6.32

脂肪:6.61

骨:-

皮膚:6.66

CAGE

大脳:1.38

小脳:-

脳幹:1.46

脳梁:1.41

松果体:1.55

末梢神経:-

脊柱:1.74

網膜:-

目:-

動脈:1.57

静脈:1.44

リンパ節:1.41

末梢血:-

脾臓:1.39

胸腺:1.91

骨髄:-

脂肪:1.25

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.87

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.38

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.50

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:164

胎盤:14.60

前立腺:90.10

卵巣:111.80

精巣:138.40

心臓:76.60

骨格筋:60.30

食道:-

胃:127.50

腸:32.40

結腸:76.30

肝臓:52.80

肺:102.60

膀胱:125.60

腎臓:52

下垂体:-

甲状腺:163.70

副腎:-

膵臓:8.90

乳腺:65.10

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.60

胎盤:5.87

前立腺:7

卵巣:6.75

精巣:6.64

心臓:6.06

骨格筋:5.87

食道:6.54

胃:6.40

腸:6.14

結腸:5.69

肝臓:6.75

肺:6.21

膀胱:-

腎臓:5.95

下垂体:6.53

甲状腺:6.54

副腎:6.85

膵臓:5.82

乳腺:6.47

唾液腺:6.12

CAGE

子宮:1.82

胎盤:0.92

前立腺:1.49

卵巣:1.81

精巣:1.33

心臓:1.31

骨格筋:1.46

食道:1.62

胃:-

腸:1.13

結腸:0.69

肝臓:1.41

肺:1.37

膀胱:1.62

腎臓:1.17

下垂体:1.72

甲状腺:1.57

副腎:-

膵臓:1.21

乳腺:1.16

唾液腺:1.49

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.44

卵巣:3.16

精巣:3.58

心臓:1.81

骨格筋:2.97

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.20

肝臓:2.41

肺:3.19

膀胱:-

腎臓:2.73

下垂体:-

甲状腺:3.71

副腎:3.99

膵臓:-

乳腺:3.56

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000123
Gene ID	2073
Unigene ID	Hs.258429
Probe set ID	202414_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000134899
GTEx ID	ENSG00000134899

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_011729
ラット[1]	NM_001106910

染色体

13q33.1 [103,459,705 - 103,528,345]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006084	DNA repair protein (XPGC)/yeast Rad
IPR001044	Xeroderma pigmentosum group G protein

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006281	DNA repair
GO:0043066	negative regulation of apoptosis
GO:0006289	nucleotide-excision repair
GO:0000718	nucleotide-excision repair, DNA damage removal
GO:0006295	nucleotide-excision repair, DNA incision, 3'-to lesion
GO:0009411	response to UV
GO:0010225	response to UV-C
GO:0006283	transcription-coupled nucleotide-excision repair
GO:0009650	UV protection

Cellular Component

GO:0016591	DNA-directed RNA polymerase II, holoenzyme
GO:0005675	holo TFIIH complex
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0000405	bubble DNA binding
GO:0003690	double-stranded DNA binding
GO:0004520	endodeoxyribonuclease activity
GO:0004519	endonuclease activity
GO:0046872	metal ion binding
GO:0005515	protein binding
GO:0042803	protein homodimerization activity
GO:0047485	protein N-terminus binding
GO:0003697	single-stranded DNA binding

excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 5

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function