SNW domain containing 1

同義遺伝子名

SKIIP, Nuclear protein SkiP, NCOA-62, SNW1, Prp45, Bx42, Ski-interacting protein, MGC119379, NCoA-62, Nuclear receptor coactivator NCoA-62, PRPF45, SNW domain-containing protein 1, SKI interacting protein, SNW domain containing 1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:19

小脳:-

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:474.60

目:35.30

動脈:149.90

静脈:66.60

リンパ節:60.70

末梢血:18.20

脾臓:18.90

胸腺:38.70

骨髄:118.10

脂肪:80.70

骨:-

皮膚:24

GeneChip

大脳:6.45

小脳:6.84

脳幹:6.51

脳梁:6.85

松果体:-

末梢神経:6.74

脊柱:6.48

網膜:-

目:-

動脈:6.68

静脈:6.81

リンパ節:6.86

末梢血:-

脾臓:6.76

胸腺:7.39

骨髄:6.96

脂肪:6.85

骨:-

皮膚:6.82

CAGE

大脳:3.43

小脳:-

脳幹:3.50

脳梁:3.62

松果体:3.77

末梢神経:-

脊柱:3.50

網膜:-

目:-

動脈:3.15

静脈:3.38

リンパ節:3.43

末梢血:-

脾臓:3.73

胸腺:3.69

骨髄:-

脂肪:3.67

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:4.52

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.46

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.92

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:32.80

前立腺:101.40

卵巣:-

精巣:26

心臓:102.20

骨格筋:522.40

食道:-

胃:21.20

腸:-

結腸:67.80

肝臓:42.20

肺:4.90

膀胱:-

腎臓:52

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:26.70

乳腺:74.30

唾液腺:328.40

GeneChip

子宮:7.31

胎盤:7.07

前立腺:7.18

卵巣:7.41

精巣:7.77

心臓:6.74

骨格筋:6.68

食道:6.96

胃:6.51

腸:6.66

結腸:6.43

肝臓:6.03

肺:6.83

膀胱:-

腎臓:6.23

下垂体:6.65

甲状腺:6.63

副腎:6.26

膵臓:6.68

乳腺:7.03

唾液腺:6.28

CAGE

子宮:3.72

胎盤:3.64

前立腺:3.69

卵巣:3.70

精巣:3.93

心臓:3.26

骨格筋:3.91

食道:3.62

胃:-

腸:3.64

結腸:3.26

肝臓:3.23

肺:3.37

膀胱:3.74

腎臓:3.36

下垂体:3.68

甲状腺:3.67

副腎:-

膵臓:2.94

乳腺:3.54

唾液腺:3.50

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.86

卵巣:5.10

精巣:5.68

心臓:3.63

骨格筋:4.56

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.65

肝臓:3.40

肺:4.73

膀胱:-

腎臓:4.14

下垂体:-

甲状腺:5.16

副腎:4.77

膵臓:-

乳腺:4.58

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_012245
Gene ID	22938
Unigene ID	Hs.445498
Probe set ID	215424_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000100603
GTEx ID	ENSG00000100603

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_025507
ラット [0]

染色体

14q24.3 [78,183,942 - 78,227,550]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0071300	cellular response to retinoic acid
GO:0042771	DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in induction of apoptosis
GO:0010467	gene expression
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0007219	Notch signaling pathway
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0043923	positive regulation by host of viral transcription
GO:0051571	positive regulation of histone H3-K4 methylation
GO:0050769	positive regulation of neurogenesis
GO:0048026	positive regulation of nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0030511	positive regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway
GO:0070564	positive regulation of vitamin D receptor signaling pathway
GO:0048385	regulation of retinoic acid receptor signaling pathway
GO:0006357	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0070562	regulation of vitamin D receptor signaling pathway
GO:0048384	retinoic acid receptor signaling pathway
GO:0006367	transcription initiation from RNA polymerase II promoter
GO:0019048	virus-host interaction

Cellular Component

GO:0071013	catalytic step 2 spliceosome
GO:0000785	chromatin
GO:0016363	nuclear matrix
GO:0044428	nuclear part
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0008024	positive transcription elongation factor complex b
GO:0071146	SMAD3-SMAD4 protein complex
GO:0005681	spliceosomal complex

Molecular Function

GO:0005112	Notch binding
GO:0035257	nuclear hormone receptor binding
GO:0005515	protein binding
GO:0042974	retinoic acid receptor binding
GO:0046332	SMAD binding
GO:0003713	transcription coactivator activity
GO:0003714	transcription corepressor activity
GO:0042809	vitamin D receptor binding

SNW domain containing 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function