sex comb on midleg homolog 1 (Drosophila)

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同義遺伝子名

sex comb on midleg homolog 1 (Drosophila), Scml3, Sex comb on midleg homolog 1, Polycomb protein SCMH1, SCMH1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:43.90 小脳:63 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:148.30 末梢神経:122.70 脊柱:- 網膜:- 目:29.40 動脈:60 静脈:- リンパ節:91 末梢血:18.20 脾臓:18.90 胸腺:154.60 骨髄:78.70 脂肪:40.30 骨:12.80 皮膚:33.60
GeneChip 大脳:5.96 小脳:6.12 脳幹:5.79 脳梁:5.75 松果体:- 末梢神経:6.10 脊柱:5.75 網膜:- 目:- 動脈:6.82 静脈:6.86 リンパ節:6.21 末梢血:- 脾臓:6.11 胸腺:6.38 骨髄:6.23 脂肪:6.64 骨:- 皮膚:5.98
CAGE 大脳:2.67 小脳:- 脳幹:2.21 脳梁:2.27 松果体:3.46 末梢神経:- 脊柱:2.58 網膜:- 目:- 動脈:3.57 静脈:2.70 リンパ節:2.54 末梢血:- 脾臓:2.35 胸腺:2.52 骨髄:- 脂肪:2.59 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.68 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.38 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.07 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:27.30 胎盤:21.90 前立腺:90.10 卵巣:149.10 精巣:103.80 心臓:38.30 骨格筋:20.10 食道:- 胃:85 腸:32.40 結腸:59.40     肝臓:95        肺:39.10    膀胱:- 腎臓:31.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:53.30 乳腺:27.90 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.69 胎盤:5.71 前立腺:7.20 卵巣:6.75 精巣:7.34 心臓:6.71 骨格筋:6.69 食道:6.21 胃:6.68 腸:6.75 結腸:6.55 肝臓:6 肺:6.40 膀胱:- 腎臓:6.61 下垂体:6.57 甲状腺:6.40 副腎:6.57 膵臓:6.59 乳腺:6.72 唾液腺:7.06
CAGE 子宮:3.21 胎盤:2.28 前立腺:3.19 卵巣:3.21 精巣:3.36 心臓:3.45 骨格筋:2.93 食道:2.73 胃:- 腸:2.88 結腸:3.09     肝臓:2.12    肺:2.69 膀胱:3.29 腎臓:2.77 下垂体:3.20 甲状腺:2.69 副腎:- 膵臓:3.57 乳腺:3.56 唾液腺:3.03
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.37 卵巣:3.01 精巣:3.05 心臓:2.04 骨格筋:1.96 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.83     肝臓:0.68        肺:2.38    膀胱:- 腎臓:2.32 下垂体:- 甲状腺:2.26 副腎:1.86 膵臓:- 乳腺:2.59 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001031694
Gene ID 22955
Unigene ID Hs.571874
Probe set ID 221216_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000010803
GTEx ID ENSG00000010803

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_001159630, NM_013883
ラット[1]  NM_001109669, NM_013883

染色体

1p34.2  [41,492,872  -  41,707,826]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001660  Sterile alpha motif
IPR010993  Sterile alpha motif homology
IPR013761  Sterile alpha motif-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10524249
10653359
12167701
12477932
14702039
14973489
15489334
16169070
16710414
16713569
17081983
18391952
19266077
20211142
20546612
20881960
22325352
23207902
23563607
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0009653  anatomical structure morphogenesis
GO:0009952  anterior/posterior pattern formation
GO:0006338  chromatin remodeling
GO:0016458  gene silencing
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0007283  spermatogenesis
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0010369  chromocenter
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0003700  transcription factor activity