LIM and calponin homology domains 1

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同義遺伝子名

DKFZp781I1455, DKFZp686G18243, DKFZp781C1754, DKFZp686G2094, DKFZp686B2470, MGC72127, DKFZp686A01247, DKFZp434I0312, DKFZP686A01247

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:167.10 小脳:88.20 脳幹:- 脳梁:87.50 松果体:- 末梢神経:276 脊柱:112.30 網膜:355.90 目:241 動脈:- 静脈:199.90 リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:56.70 胸腺:25.80 骨髄:- 脂肪:121 骨:102.40 皮膚:100.80
GeneChip 大脳:9.05 小脳:7.96 脳幹:9.16 脳梁:9.87 松果体:- 末梢神経:8.54 脊柱:9.43 網膜:- 目:- 動脈:8.43 静脈:7.61 リンパ節:5.55 末梢血:- 脾臓:9.76 胸腺:5.17 骨髄:4.16 脂肪:7.71 骨:- 皮膚:6.88
CAGE 大脳:4.71 小脳:- 脳幹:5.07 脳梁:5.15 松果体:3.37 末梢神経:- 脊柱:5.27 網膜:- 目:- 動脈:5.08 静脈:3.18 リンパ節:2.63 末梢血:- 脾臓:4.91 胸腺:1.78 骨髄:- 脂肪:4.07 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.50 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.35 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.25 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:63.80 胎盤:149.40 前立腺:169 卵巣:74.50 精巣:99.50 心臓:114.90 骨格筋:140.60 食道:- 胃:42.50 腸:64.80 結腸:-     肝臓:285        肺:180.80    膀胱:- 腎臓:93.60 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:133.40 乳腺:204.40 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.28 胎盤:8.22 前立腺:9.27 卵巣:7.40 精巣:5 心臓:8.20 骨格筋:9.05 食道:7.58 胃:6.35 腸:6.15 結腸:5.21 肝臓:6.06 肺:10.01 膀胱:- 腎臓:7.17 下垂体:7.82 甲状腺:8.69 副腎:8.32 膵臓:4.27 乳腺:7.39 唾液腺:8.79
CAGE 子宮:2.91 胎盤:4.44 前立腺:4.07 卵巣:2.98 精巣:2.37 心臓:4.97 骨格筋:5.05 食道:3.39 胃:- 腸:2.34 結腸:2.82     肝臓:3.35    肺:5.21 膀胱:3.63 腎臓:3.65 下垂体:3.79 甲状腺:4.44 副腎:- 膵臓:2.26 乳腺:3.90 唾液腺:4.53
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.25 卵巣:2.31 精巣:2.03 心臓:2.01 骨格筋:0.82 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.61     肝臓:0.94        肺:4.42    膀胱:- 腎臓:3.06 下垂体:- 甲状腺:3.94 副腎:0.93 膵臓:- 乳腺:1.56 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001112720
Gene ID 22998
Unigene ID Hs.335163
Probe set ID 212328_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000064042
GTEx ID ENSG00000064042

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_001001980
ラット [0]  

染色体

4p13  [41,361,624  -  41,702,061]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001997  Calponin
IPR016146  Calponin-homology
IPR001715  Calponin-like actin-binding
IPR003096  SM22/calponin

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9847074
10470851
11076863
11230166
11256614
12477932
15302935
15489336
16344560
16381901
19322201
19531213
20379614
21832049
22863883
22939629
23793025
24332808

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0031032  actomyosin structure organization

Molecular Function

GO:0003779  actin binding
GO:0008270  zinc ion binding