ATP-binding cassette, sub-family F (GCN20), member 1

同義遺伝子名

ATP-binding cassette 50, ABC27, TNF-alpha-stimulated ABC protein, ABCF1, EST123147, ATP-binding cassette sub-family F member 1, ABC50

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:6.87

小脳:6.85

脳幹:6.87

脳梁:6.83

松果体:-

末梢神経:7.20

脊柱:6.92

網膜:-

目:-

動脈:7.42

静脈:7.11

リンパ節:7.40

末梢血:-

脾臓:7.21

胸腺:7.61

骨髄:7.29

脂肪:7.20

骨:-

皮膚:7.45

CAGE

大脳:4.37

小脳:-

脳幹:4.17

脳梁:4.16

松果体:4.75

末梢神経:-

脊柱:4.68

網膜:-

目:-

動脈:4.36

静脈:4.23

リンパ節:4.22

末梢血:-

脾臓:4.37

胸腺:4.33

骨髄:-

脂肪:4.34

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:7.11

胎盤:7.87

前立腺:7.24

卵巣:7.09

精巣:8.13

心臓:6.88

骨格筋:7.94

食道:7.40

胃:7.16

腸:7.20

結腸:7.35

肝臓:6.94

肺:7.28

膀胱:-

腎臓:7.26

下垂体:7.37

甲状腺:7.12

副腎:7.07

膵臓:7.09

乳腺:7.37

唾液腺:7

CAGE

子宮:4.26

胎盤:4.78

前立腺:4.23

卵巣:4.15

精巣:4.68

心臓:4.44

骨格筋:5.57

食道:4.21

胃:-

腸:4.49

結腸:4.07

肝臓:4.55

肺:4.20

膀胱:4.35

腎臓:4.53

下垂体:4.60

甲状腺:3.98

副腎:-

膵臓:4.37

乳腺:4.23

唾液腺:4.09

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0

卵巣:0

精巣:0

心臓:0

骨格筋:0

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0

肝臓:0

肺:0

膀胱:-

腎臓:0

下垂体:-

甲状腺:0

副腎:0

膵臓:-

乳腺:0

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001025091
Gene ID	23
Unigene ID	-
Probe set ID	200045_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000204574
GTEx ID	ENSG00000204574

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_013854
ラット [0]

染色体

HSCHR6_MHC_MANN [30,583,828 - 30,609,632]

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HSCHR6_MHC_SSTO [30,530,573 - 30,556,377]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_MCF [30,617,610 - 30,643,414]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

6p21.33 [30,539,153 - 30,564,956]

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- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_DBB [30,529,391 - 30,555,197]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_COX [30,529,000 - 30,554,805]

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HSCHR6_MHC_QBL [30,528,662 - 30,554,466]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003439	ABC transporter-like
IPR003593	ATPase, AAA+ type, core

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006954	inflammatory response
GO:0045727	positive regulation of translation
GO:0042254	ribosome biogenesis
GO:0006412	translation
GO:0006413	translational initiation

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005635	nuclear envelope
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0042788	polysomal ribosome
GO:0005840	ribosome

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0016887	ATPase activity
GO:0005515	protein binding
GO:0043022	ribosome binding
GO:0008494	translation activator activity
GO:0008135	translation factor activity, nucleic acid binding

ATP-binding cassette, sub-family F (GCN20), member 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function