CCR4-NOT transcription complex, subunit 1

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同義遺伝子名

KIAA1007, DKFZp686E0722, CDC39, NOT1H, FLJ90644, AD-005, CCR4-NOT transcription complex, subunit 1, NOT1, CNOT1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:7.53

小脳:7.84

脳幹:7.42

脳梁:7.75

松果体:-

末梢神経:7.87

脊柱:7.63

網膜:-

目:-

動脈:8.13

静脈:8.06

リンパ節:8.53

末梢血:-

脾臓:8.48

胸腺:8.96

骨髄:8.54

脂肪:8.14

骨:-

皮膚:8.34

CAGE

大脳:3.88

小脳:-

脳幹:3.86

脳梁:3.98

松果体:4.20

末梢神経:-

脊柱:3.99

網膜:-

目:-

動脈:4.10

静脈:4.32

リンパ節:4.39

末梢血:-

脾臓:4.37

胸腺:4.73

骨髄:-

脂肪:4.15

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.15

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.09

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.84

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:8.48

胎盤:8.06

前立腺:8.53

卵巣:8.70

精巣:10.13

心臓:7.87

骨格筋:8.49

食道:9.10

胃:8.30

腸:8.26

結腸:8.32

肝臓:8.01

肺:8.29

膀胱:-

腎臓:8.13

下垂体:8.13

甲状腺:8.09

副腎:8.12

膵臓:7.99

乳腺:8.32

唾液腺:8.25

CAGE

子宮:4.18

胎盤:4.18

前立腺:3.93

卵巣:4.06

精巣:5.11

心臓:4.07

骨格筋:4.18

食道:4.38

胃:-

腸:4.49

結腸:4.33

肝臓:4.00

肺:4.21

膀胱:4.24

腎臓:3.99

下垂体:4.41

甲状腺:3.88

副腎:-

膵臓:3.93

乳腺:3.67

唾液腺:4.24

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.26

卵巣:4.37

精巣:5.59

心臓:3.51

骨格筋:4.23

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.76

肝臓:3.25

肺:4.02

膀胱:-

腎臓:4.21

下垂体:-

甲状腺:4.20

副腎:3.85

膵臓:-

乳腺:3.81

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_016284
Gene ID	23019
Unigene ID	-
Probe set ID	200860_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000125107
GTEx ID	ENSG00000125107

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_001205226, NM_153164, NM_178078
ラット[1]	NM_001134840, NM_153164, NM_178078

染色体

16q21 [58,553,855 - 58,663,750]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0010467	gene expression
GO:0031047	gene silencing by RNA
GO:0016071	mRNA metabolic process
GO:0007275	multicellular organismal development
GO:0033147	negative regulation of estrogen receptor signaling pathway
GO:0048387	negative regulation of retinoic acid receptor signaling pathway
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0000288	nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay
GO:0000289	nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
GO:0010606	positive regulation of cytoplasmic mRNA processing body assembly
GO:0060213	positive regulation of nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
GO:0006417	regulation of translation
GO:0016070	RNA metabolic process
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0030014	CCR4-NOT complex
GO:0000932	cytoplasmic mRNA processing body
GO:0005829	cytosol
GO:0005634	nucleus
GO:0005778	peroxisomal membrane

Molecular Function

GO:0030331	estrogen receptor binding
GO:0004535	poly(A)-specific ribonuclease activity
GO:0005515	protein binding
GO:0042974	retinoic acid receptor binding

CCR4-NOT transcription complex, subunit 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function