CCR4-NOT transcription complex, subunit 1

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同義遺伝子名

KIAA1007, DKFZp686E0722, CDC39, NOT1H, FLJ90644, AD-005, CCR4-NOT transcription complex, subunit 1, NOT1, CNOT1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:101.90

小脳:151.10

脳幹:-

脳梁:87.50

松果体:296.70

末梢神経:153.40

脊柱:-

網膜:355.90

目:52.90

動脈:89.90

静脈:533.20

リンパ節:171.90

末梢血:72.90

脾臓:151.30

胸腺:244.80

骨髄:78.70

脂肪:40.30

骨:51.20

皮膚:139.20

GeneChip

nodata

CAGE

大脳:3.88

小脳:-

脳幹:3.86

脳梁:3.98

松果体:4.20

末梢神経:-

脊柱:3.99

網膜:-

目:-

動脈:4.10

静脈:4.32

リンパ節:4.39

末梢血:-

脾臓:4.37

胸腺:4.73

骨髄:-

脂肪:4.15

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.09

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.44

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.46

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:127.60

胎盤:112.90

前立腺:56.30

卵巣:74.50

精巣:428.30

心臓:51.10

骨格筋:160.70

食道:-

胃:870.90

腸:129.60

結腸:305.30

肝臓:63.30

肺:180.80

膀胱:-

腎臓:104

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:101.60

膵臓:71.10

乳腺:204.40

唾液腺:328.40

GeneChip

nodata

CAGE

子宮:4.18

胎盤:4.18

前立腺:3.93

卵巣:4.06

精巣:5.11

心臓:4.07

骨格筋:4.18

食道:4.38

胃:-

腸:4.49

結腸:4.33

肝臓:4.00

肺:4.21

膀胱:4.24

腎臓:3.99

下垂体:4.41

甲状腺:3.88

副腎:-

膵臓:3.93

乳腺:3.67

唾液腺:4.24

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.17

卵巣:0.32

精巣:0.67

心臓:0.27

骨格筋:0.37

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.22

肝臓:0.07

肺:0.15

膀胱:-

腎臓:0.06

下垂体:-

甲状腺:0.65

副腎:0.39

膵臓:-

乳腺:0.17

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_206999
Gene ID	23019
Unigene ID	Hs.460923
Probe set ID	-
Ensembl ID	ENSG00000125107
GTEx ID	ENSG00000125107

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_001205226, NM_153164, NM_178078
ラット[1]	NM_001134840, NM_153164, NM_178078

染色体

16q21 [58,553,855 - 58,663,750]

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遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0010467	gene expression
GO:0031047	gene silencing by RNA
GO:0016071	mRNA metabolic process
GO:0007275	multicellular organismal development
GO:0033147	negative regulation of estrogen receptor signaling pathway
GO:0048387	negative regulation of retinoic acid receptor signaling pathway
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0000288	nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay
GO:0000289	nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
GO:0010606	positive regulation of cytoplasmic mRNA processing body assembly
GO:0060213	positive regulation of nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
GO:0006417	regulation of translation
GO:0016070	RNA metabolic process
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0030014	CCR4-NOT complex
GO:0000932	cytoplasmic mRNA processing body
GO:0005829	cytosol
GO:0005634	nucleus
GO:0005778	peroxisomal membrane

Molecular Function

GO:0030331	estrogen receptor binding
GO:0004535	poly(A)-specific ribonuclease activity
GO:0005515	protein binding
GO:0042974	retinoic acid receptor binding