lysine (K)-specific demethylase 6B

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同義遺伝子名

JMJD3, jumonji domain containing 3, KIAA0346

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:4.70

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:-

網膜:-

目:58.80

動脈:-

静脈:-

リンパ節:101.10

末梢血:54.70

脾臓:18.90

胸腺:25.80

骨髄:59

脂肪:-

骨:-

皮膚:19.20

GeneChip

大脳:5.30

小脳:5.55

脳幹:5.28

脳梁:5.24

松果体:-

末梢神経:5.61

脊柱:5.54

網膜:-

目:-

動脈:6.47

静脈:5.91

リンパ節:6.08

末梢血:-

脾臓:6.56

胸腺:6.73

骨髄:6.11

脂肪:6.25

骨:-

皮膚:5.72

CAGE

大脳:0.86

小脳:-

脳幹:0.58

脳梁:0.96

松果体:1.23

末梢神経:-

脊柱:0.56

網膜:-

目:-

動脈:1.38

静脈:1.61

リンパ節:0.77

末梢血:-

脾臓:1.12

胸腺:1.99

骨髄:-

脂肪:1.44

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.99

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.73

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.04

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:18.20

前立腺:11.30

卵巣:-

精巣:13

心臓:25.50

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:17

肝臓:-

肺:78.20

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:17.80

乳腺:9.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.93

胎盤:5.17

前立腺:5.99

卵巣:6

精巣:6.75

心臓:6

骨格筋:5.31

食道:6.06

胃:6.04

腸:5.44

結腸:5.69

肝臓:6.22

肺:6.61

膀胱:-

腎臓:6.10

下垂体:6.59

甲状腺:6.26

副腎:6.93

膵臓:5.14

乳腺:6.19

唾液腺:5.81

CAGE

子宮:1.27

胎盤:0.85

前立腺:1.03

卵巣:1.53

精巣:1.97

心臓:1.03

骨格筋:0.84

食道:1.08

胃:-

腸:1.52

結腸:0.84

肝臓:0.96

肺:1.76

膀胱:1.30

腎臓:1.01

下垂体:1.39

甲状腺:0.76

副腎:-

膵臓:0

乳腺:0.55

唾液腺:0.83

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.65

卵巣:3.49

精巣:2.68

心臓:1.85

骨格筋:1.91

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.24

肝臓:1.16

肺:3.77

膀胱:-

腎臓:1.73

下垂体:-

甲状腺:2.12

副腎:2.20

膵臓:-

乳腺:2.20

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001080424
Gene ID	23135
Unigene ID	Hs.223678
Probe set ID	213146_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000132510
GTEx ID	ENSG00000132510

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_001017426
ラット[1]	NM_001108829

染色体

17p13.1 [7,743,222 - 7,758,106]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003347

Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0016577	histone demethylation
GO:0006954	inflammatory response
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

GO:0005634

nucleus

Molecular Function

GO:0046872	metal ion binding
GO:0016702	oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0043565	sequence-specific DNA binding

lysine (K)-specific demethylase 6B

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function