Rtf1, Paf1/RNA polymerase II complex component, homolog (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

KIAA0252, RTF1, GTL7

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:45

小脳:37.80

脳幹:-

脳梁:58.30

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:129.30

動脈:-

静脈:66.60

リンパ節:40.40

末梢血:36.40

脾臓:18.90

胸腺:38.70

骨髄:39.40

脂肪:80.70

骨:51.20

皮膚:28.80

GeneChip

大脳:6.52

小脳:6.83

脳幹:6.47

脳梁:6.30

松果体:-

末梢神経:6.34

脊柱:6.25

網膜:-

目:-

動脈:6.60

静脈:6.60

リンパ節:6.36

末梢血:-

脾臓:6.56

胸腺:7.10

骨髄:6.77

脂肪:6.37

骨:-

皮膚:6.09

CAGE

大脳:4.38

小脳:-

脳幹:3.99

脳梁:3.89

松果体:4.47

末梢神経:-

脊柱:3.95

網膜:-

目:-

動脈:3.83

静脈:4.15

リンパ節:3.70

末梢血:-

脾臓:4.32

胸腺:4.23

骨髄:-

脂肪:4.25

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:4.20

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.98

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.24

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:54.70

胎盤:29.10

前立腺:112.60

卵巣:37.30

精巣:99.50

心臓:38.30

骨格筋:160.70

食道:-

胃:63.70

腸:32.40

結腸:25.40

肝臓:73.90

肺:73.30

膀胱:-

腎臓:135.20

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:26.70

乳腺:120.80

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.05

胎盤:6.33

前立腺:6.62

卵巣:6.98

精巣:7.26

心臓:6.57

骨格筋:6.59

食道:6.52

胃:6.50

腸:6.54

結腸:6.37

肝臓:6.13

肺:6.53

膀胱:-

腎臓:6.25

下垂体:6.22

甲状腺:6.61

副腎:6.54

膵臓:5.94

乳腺:6.39

唾液腺:6.15

CAGE

子宮:4.42

胎盤:4.69

前立腺:4.30

卵巣:4.30

精巣:4.47

心臓:4.17

骨格筋:4.95

食道:4.22

胃:-

腸:4.19

結腸:3.80

肝臓:3.97

肺:3.83

膀胱:4.53

腎臓:3.92

下垂体:4.23

甲状腺:4.12

副腎:-

膵臓:3.61

乳腺:3.52

唾液腺:3.74

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.07

卵巣:4.26

精巣:4.49

心臓:3.37

骨格筋:4.01

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.74

肝臓:2.59

肺:3.37

膀胱:-

腎臓:3.31

下垂体:-

甲状腺:4.37

副腎:4.11

膵臓:-

乳腺:3.67

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_015138
Gene ID	23168
Unigene ID	Hs.511096
Probe set ID	212302_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000137815
GTEx ID	ENSG00000137815

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_030112
ラット[1]	NM_001108958

染色体

15q15.1 [41,709,302 - 41,775,761]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR004343	Plus-3
IPR018144	Plus-3 domain, subgroup

GO:0001711	endodermal cell fate commitment
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0051571	positive regulation of histone H3-K4 methylation
GO:0032968	positive regulation of RNA elongation from RNA polymerase II promoter
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0019827	stem cell maintenance
GO:0006352	transcription initiation
GO:0016055	Wnt receptor signaling pathway

GO:0016593	Cdc73/Paf1 complex
GO:0005730	nucleolus

GO:0005515	protein binding
GO:0003697	single-stranded DNA binding

Rtf1, Paf1/RNA polymerase II complex component, homolog (S. cerevisiae)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function