jumonji domain containing 6

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同義遺伝子名

Phosphatidylserine receptor, PTDSR, PTDSR1, Protein PTDSR, PSR, phosphatidylserine receptor, KIAA0585

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:42.70 小脳:37.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:355.90 目:76.40 動脈:89.90 静脈:66.60 リンパ節:50.60 末梢血:145.70 脾臓:37.80 胸腺:12.90 骨髄:19.70 脂肪:80.70 骨:64 皮膚:14.40
GeneChip 大脳:5.78 小脳:6.65 脳幹:5.60 脳梁:5.73 松果体:- 末梢神経:4.99 脊柱:5.50 網膜:- 目:- 動脈:5.24 静脈:5.28 リンパ節:4.86 末梢血:- 脾臓:5.11 胸腺:4.59 骨髄:4.80 脂肪:4.99 骨:- 皮膚:4.88
CAGE 大脳:2.97 小脳:- 脳幹:3.10 脳梁:2.78 松果体:3.04 末梢神経:- 脊柱:3.16 網膜:- 目:- 動脈:3.34 静脈:2.90 リンパ節:2.48 末梢血:- 脾臓:2.77 胸腺:2.19 骨髄:- 脂肪:2.95 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.83 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.79 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.65 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:36.50 胎盤:54.60 前立腺:123.90 卵巣:223.60 精巣:60.60 心臓:12.80 骨格筋:- 食道:- 胃:21.20 腸:97.20 結腸:59.40     肝臓:63.30        肺:39.10    膀胱:- 腎臓:62.40 下垂体:- 甲状腺:163.70 副腎:101.60 膵臓:88.90 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.79 胎盤:4.73 前立腺:4.80 卵巣:4.99 精巣:5.08 心臓:5.77 骨格筋:6.30 食道:4.93 胃:4.91 腸:5.12 結腸:5.08 肝臓:5.09 肺:5.11 膀胱:- 腎臓:5.08 下垂体:5.35 甲状腺:4.94 副腎:5.40 膵臓:5.08 乳腺:4.86 唾液腺:4.83
CAGE 子宮:2.67 胎盤:2.58 前立腺:3.10 卵巣:2.95 精巣:3.39 心臓:3.46 骨格筋:3.38 食道:3.07 胃:- 腸:2.84 結腸:2.82     肝臓:2.33    肺:2.92 膀胱:3.38 腎臓:2.46 下垂体:3.17 甲状腺:2.91 副腎:- 膵臓:2.76 乳腺:3.38 唾液腺:2.57
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.74 卵巣:2.17 精巣:1.85 心臓:2.62 骨格筋:3.39 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.10     肝臓:0.34        肺:1.06    膀胱:- 腎臓:1.42 下垂体:- 甲状腺:3.07 副腎:1.14 膵臓:- 乳腺:1.24 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001081461
Gene ID 23210
Unigene ID Hs.514505
Probe set ID 215233_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000070495
GTEx ID ENSG00000070495

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_033398
ラット[2]  NM_033398

染色体

17q25.1  [74,708,919  -  74,722,866]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003347  Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9628581
10811223
11877474
12477932
12559004
12898702
14645848
14702039
14729065
15072554
15193161
15345036
15453906
15469976
15489334
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16983801
17534701
17947579
18564434
19492415
19574390
20574068
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20684070
21139048
21300889
21890473
21906983
21963094
22189873
22505724
22621393
22701020
22863883
23303181
23455924
23595221
23688307
23776548
24360279
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006915  apoptosis
GO:0007166  cell surface receptor linked signal transduction
GO:0048821  erythrocyte development
GO:0007507  heart development
GO:0070078  histone H3-R2 demethylation
GO:0070079  histone H4-R3 demethylation
GO:0001822  kidney development
GO:0030324  lung development
GO:0042116  macrophage activation
GO:0006397  mRNA processing
GO:0018395  peptidyl-lysine hydroxylation to 5-hydroxy-L-lysine
GO:0043654  recognition of apoptotic cell
GO:0048024  regulation of nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0060041  retina development in camera-type eye
GO:0008380  RNA splicing
GO:0002040  sprouting angiogenesis
GO:0033077  T cell differentiation in the thymus
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005730  nucleolus
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0033746  histone demethylase activity (H3-R2 specific)
GO:0033749  histone demethylase activity (H4-R3 specific)
GO:0042802  identical protein binding
GO:0005506  iron ion binding
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0070815  peptidyl-lysine 5-dioxygenase activity
GO:0005515  protein binding
GO:0004872  receptor activity
GO:0003723  RNA binding
GO:0003727  single-stranded RNA binding