jumonji domain containing 6

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

Phosphatidylserine receptor, PTDSR, PTDSR1, Protein PTDSR, PSR, phosphatidylserine receptor, KIAA0585

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:42.70 小脳:37.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:355.90 目:76.40 動脈:89.90 静脈:66.60 リンパ節:50.60 末梢血:145.70 脾臓:37.80 胸腺:12.90 骨髄:19.70 脂肪:80.70 骨:64 皮膚:14.40
GeneChip 大脳:5.68 小脳:5.11 脳幹:5.88 脳梁:6.27 松果体:- 末梢神経:6.45 脊柱:6.20 網膜:- 目:- 動脈:7.72 静脈:7.99 リンパ節:7.21 末梢血:- 脾臓:7.42 胸腺:6.83 骨髄:7.66 脂肪:6.69 骨:- 皮膚:6.81
CAGE 大脳:2.97 小脳:- 脳幹:3.10 脳梁:2.78 松果体:3.04 末梢神経:- 脊柱:3.16 網膜:- 目:- 動脈:3.34 静脈:2.90 リンパ節:2.48 末梢血:- 脾臓:2.77 胸腺:2.19 骨髄:- 脂肪:2.95 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.96 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:4.16 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.98 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:36.50 胎盤:54.60 前立腺:123.90 卵巣:223.60 精巣:60.60 心臓:12.80 骨格筋:- 食道:- 胃:21.20 腸:97.20 結腸:59.40     肝臓:63.30        肺:39.10    膀胱:- 腎臓:62.40 下垂体:- 甲状腺:163.70 副腎:101.60 膵臓:88.90 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.76 胎盤:6.56 前立腺:7.06 卵巣:6.82 精巣:7.69 心臓:7.07 骨格筋:6.19 食道:6.95 胃:7.04 腸:6.86 結腸:6.46 肝臓:6.68 肺:8.05 膀胱:- 腎臓:6.71 下垂体:6.67 甲状腺:6.78 副腎:7.65 膵臓:6.39 乳腺:6.83 唾液腺:6.77
CAGE 子宮:2.67 胎盤:2.58 前立腺:3.10 卵巣:2.95 精巣:3.39 心臓:3.46 骨格筋:3.38 食道:3.07 胃:- 腸:2.84 結腸:2.82     肝臓:2.33    肺:2.92 膀胱:3.38 腎臓:2.46 下垂体:3.17 甲状腺:2.91 副腎:- 膵臓:2.76 乳腺:3.38 唾液腺:2.57
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.99 卵巣:3.07 精巣:3.61 心臓:2.08 骨格筋:1.42 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:4.14     肝臓:2.24        肺:4.58    膀胱:- 腎臓:2.97 下垂体:- 甲状腺:2.67 副腎:2.78 膵臓:- 乳腺:2.24 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_015167
Gene ID 23210
Unigene ID Hs.514505
Probe set ID 212723_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000070495
GTEx ID ENSG00000070495

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_033398
ラット[2]  NM_033398

染色体

17q25.1  [74,708,919  -  74,722,866]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003347  Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9628581
10811223
11877474
12477932
12559004
12898702
14645848
14702039
14729065
15072554
15193161
15345036
15453906
15469976
15489334
15622002
16983801
17534701
17947579
18564434
19492415
19574390
20574068
20679243
20684070
21139048
21300889
21890473
21906983
21963094
22189873
22505724
22621393
22701020
22863883
23303181
23455924
23595221
23688307
23776548
24360279
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006915  apoptosis
GO:0007166  cell surface receptor linked signal transduction
GO:0048821  erythrocyte development
GO:0007507  heart development
GO:0070078  histone H3-R2 demethylation
GO:0070079  histone H4-R3 demethylation
GO:0001822  kidney development
GO:0030324  lung development
GO:0042116  macrophage activation
GO:0006397  mRNA processing
GO:0018395  peptidyl-lysine hydroxylation to 5-hydroxy-L-lysine
GO:0043654  recognition of apoptotic cell
GO:0048024  regulation of nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0060041  retina development in camera-type eye
GO:0008380  RNA splicing
GO:0002040  sprouting angiogenesis
GO:0033077  T cell differentiation in the thymus
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005730  nucleolus
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0033746  histone demethylase activity (H3-R2 specific)
GO:0033749  histone demethylase activity (H4-R3 specific)
GO:0042802  identical protein binding
GO:0005506  iron ion binding
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0070815  peptidyl-lysine 5-dioxygenase activity
GO:0005515  protein binding
GO:0004872  receptor activity
GO:0003723  RNA binding
GO:0003727  single-stranded RNA binding