vacuolar protein sorting 13 homolog A (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

Chorein, Vacuolar protein sorting-associated protein 13A, KIAA0986, vacuolar protein sorting 13A (yeast), chorea acanthocytosis, CHAC, Chorea-acanthocytosis protein, VPS13A, FLJ42030

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:33.20 小脳:63 脳幹:- 脳梁:58.30 松果体:148.30 末梢神経:92 脊柱:112.30 網膜:- 目:29.40 動脈:30 静脈:66.60 リンパ節:80.90 末梢血:- 脾臓:56.70 胸腺:51.50 骨髄:78.70 脂肪:121 骨:12.80 皮膚:24
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.77 小脳:- 脳幹:3.40 脳梁:2.62 松果体:4.05 末梢神経:- 脊柱:3.42 網膜:- 目:- 動脈:3.73 静脈:3.26 リンパ節:3.34 末梢血:- 脾臓:3.43 胸腺:3.96 骨髄:- 脂肪:3.55 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.20 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.69 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.00 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:18.20 前立腺:78.90 卵巣:74.50 精巣:86.50 心臓:- 骨格筋:60.30 食道:- 胃:148.70 腸:32.40 結腸:59.40     肝臓:42.20        肺:44    膀胱:- 腎臓:156 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:106.70 乳腺:92.90 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:3.68 胎盤:2.74 前立腺:3.55 卵巣:3.24 精巣:4.02 心臓:3.87 骨格筋:4.30 食道:3.63 胃:- 腸:4.37 結腸:4.00     肝臓:3.18    肺:3.78 膀胱:3.54 腎臓:3.75 下垂体:4.34 甲状腺:3.40 副腎:- 膵臓:3.20 乳腺:3.27 唾液腺:3.53
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.04 卵巣:0.14 精巣:1.58 心臓:1.15 骨格筋:2.02 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.05     肝臓:0.87        肺:0.83    膀胱:- 腎臓:1.20 下垂体:- 甲状腺:1.60 副腎:1.34 膵臓:- 乳腺:1.66 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001018037
Gene ID 23230
Unigene ID Hs.459790
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000197969
GTEx ID ENSG00000197969

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_173028
ラット[1]  NM_001100975

染色体

9q21.2  [79,792,269  -  80,036,457]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9382101
10231032
10737800
11381253
11381254
12477932
12671946
14702039
15146197
15164053
15489334
15498460
15918062
17474147
17673232
17998451
20301334
20301561
20379614
20972266
21139048
21598378
21733561
21890473
21906983
21963094
21987550
21987572
22038564
22227296
22366033
23568775
23746940
24129186
24250222

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0008219  cell death
GO:0006895  Golgi to endosome transport
GO:0007626  locomotory behavior
GO:0007399  nervous system development
GO:0008104  protein localization
GO:0015031  protein transport
GO:0035176  social behavior

Cellular Component

GO:0031045  dense core granule
GO:0005622  intracellular

Molecular Function

GO:0005515  protein binding