Smg-6 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans)

同義遺伝子名

Ever shorter telomeres 1A, Telomerase-binding protein EST1A, chromosome 17 open reading frame 31, EST1A, Telomerase subunit EST1A, KIAA0732, C17orf31, hSmg5/7a, EST1-like protein A, SMG-6, SMG6

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:30.80

小脳:25.20

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:122.70

脊柱:-

網膜:355.90

目:129.30

動脈:30

静脈:1333

リンパ節:40.40

末梢血:18.20

脾臓:37.80

胸腺:90.20

骨髄:157.40

脂肪:-

骨:-

皮膚:86.40

GeneChip

大脳:5.79

小脳:5.85

脳幹:5.85

脳梁:5.77

松果体:-

末梢神経:5.75

脊柱:5.78

網膜:-

目:-

動脈:6.11

静脈:6.17

リンパ節:5.97

末梢血:-

脾臓:5.72

胸腺:5.71

骨髄:5.56

脂肪:5.94

骨:-

皮膚:5.90

CAGE

大脳:3.23

小脳:-

脳幹:3.07

脳梁:3.36

松果体:3.79

末梢神経:-

脊柱:3.19

網膜:-

目:-

動脈:3.37

静脈:3.38

リンパ節:3.13

末梢血:-

脾臓:2.85

胸腺:3.51

骨髄:-

脂肪:2.95

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.62

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.33

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.72

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:72.90

胎盤:83.80

前立腺:33.80

卵巣:111.80

精巣:121.10

心臓:51.10

骨格筋:80.40

食道:-

胃:63.70

腸:-

結腸:110.20

肝臓:52.80

肺:92.90

膀胱:-

腎臓:41.60

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:101.60

膵臓:71.10

乳腺:139.40

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.95

胎盤:5.28

前立腺:5.68

卵巣:6.12

精巣:6.45

心臓:5.77

骨格筋:5.57

食道:5.94

胃:5.72

腸:5.62

結腸:5.65

肝臓:5.68

肺:5.84

膀胱:-

腎臓:5.85

下垂体:6.44

甲状腺:6.19

副腎:6.12

膵臓:5.29

乳腺:6.16

唾液腺:5.47

CAGE

子宮:3.35

胎盤:2.38

前立腺:3.12

卵巣:3.34

精巣:3.91

心臓:2.87

骨格筋:2.47

食道:2.93

胃:-

腸:2.84

結腸:2.95

肝臓:1.90

肺:2.97

膀胱:2.97

腎臓:2.66

下垂体:3.17

甲状腺:2.78

副腎:-

膵臓:2.76

乳腺:2.59

唾液腺:2.46

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.18

卵巣:3.88

精巣:3.66

心臓:1.96

骨格筋:2.58

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.54

肝臓:1.28

肺:2.41

膀胱:-

腎臓:2.31

下垂体:-

甲状腺:3.12

副腎:3.09

膵臓:-

乳腺:2.48

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_017575
Gene ID	23293
Unigene ID	Hs.448342
Probe set ID	214940_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000070366
GTEx ID	ENSG00000070366

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_001002764
ラット[1]	NM_001105808

染色体

17p13.3 [1,963,133 - 2,207,069]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

GO:0010467	gene expression
GO:0006406	mRNA export from nucleus
GO:0016071	mRNA metabolic process
GO:0000184	nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
GO:0035303	regulation of dephosphorylation
GO:0016070	RNA metabolic process
GO:0000723	telomere maintenance

GO:0000781	chromosome, telomeric region
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus
GO:0005697	telomerase holoenzyme complex

GO:0004521	endoribonuclease activity
GO:0046872	metal ion binding
GO:0005515	protein binding
GO:0042162	telomeric DNA binding

Smg-6 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function