vacuolar protein sorting 39 homolog (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

hVam6p, KIAA0770, FLJ46546, vacuolar protein sorting 39 (yeast), VPS39, FLJ21681, Vam6/Vps39-like protein

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:58.10

小脳:100.80

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:61.30

脊柱:-

網膜:-

目:52.90

動脈:-

静脈:133.30

リンパ節:182

末梢血:18.20

脾臓:132.30

胸腺:141.70

骨髄:78.70

脂肪:-

骨:76.80

皮膚:86.40

GeneChip

大脳:7.02

小脳:6.78

脳幹:7.05

脳梁:6.87

松果体:-

末梢神経:7.02

脊柱:6.89

網膜:-

目:-

動脈:6.98

静脈:6.75

リンパ節:7.08

末梢血:-

脾臓:6.92

胸腺:7.11

骨髄:6.89

脂肪:7.03

骨:-

皮膚:6.87

CAGE

大脳:3.65

小脳:-

脳幹:3.56

脳梁:3.73

松果体:3.46

末梢神経:-

脊柱:3.34

網膜:-

目:-

動脈:3.42

静脈:3.39

リンパ節:3.37

末梢血:-

脾臓:3.13

胸腺:3.38

骨髄:-

脂肪:3.23

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.93

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.48

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.66

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:118.50

胎盤:76.50

前立腺:78.90

卵巣:37.30

精巣:108.20

心臓:38.30

骨格筋:-

食道:-

胃:21.20

腸:-

結腸:101.80

肝臓:21.10

肺:34.20

膀胱:125.60

腎臓:52

下垂体:-

甲状腺:163.70

副腎:50.80

膵臓:44.50

乳腺:92.90

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.95

胎盤:6.59

前立腺:7.06

卵巣:7

精巣:7.08

心臓:6.89

骨格筋:7.03

食道:6.95

胃:6.98

腸:6.84

結腸:6.74

肝臓:6.83

肺:6.80

膀胱:-

腎臓:6.94

下垂体:7.33

甲状腺:7.04

副腎:7.02

膵臓:6.66

乳腺:7.06

唾液腺:7.07

CAGE

子宮:3.47

胎盤:3.30

前立腺:3.23

卵巣:3.19

精巣:3.33

心臓:3.22

骨格筋:3.36

食道:2.97

胃:-

腸:3.22

結腸:3.30

肝臓:2.67

肺:3.21

膀胱:3.14

腎臓:3.08

下垂体:3.54

甲状腺:3.14

副腎:-

膵臓:3.42

乳腺:3.09

唾液腺:3.83

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.01

卵巣:3.98

精巣:3.85

心臓:3.53

骨格筋:3.29

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.22

肝臓:2.41

肺:2.81

膀胱:-

腎臓:3.45

下垂体:-

甲状腺:4.10

副腎:4.14

膵臓:-

乳腺:3.88

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_015289
Gene ID	23339
Unigene ID	Hs.88025
Probe set ID	212156_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000166887
GTEx ID	ENSG00000166887

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_147153, NM_178851
ラット[1]	NM_001012186, NM_178851

染色体

15q15.1 [42,450,899 - 42,500,514]

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遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

protein transport

Cellular Component

GO:0030897	HOPS complex
GO:0031902	late endosome membrane
GO:0005765	lysosomal membrane

Molecular Function

small GTPase regulator activity