chromobox homolog 5 (HP1 alpha homolog, Drosophila)

同義遺伝子名

Heterochromatin protein 1 homolog alpha, chromobox homolog 5 (Drosophila HP1 alpha), HP1A, HP1-ALPHA, HP1, CBX5, HP1Hs-alpha, HP1 alpha, Antigen p25, Chromobox protein homolog 5

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:135.10

小脳:63

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:184

脊柱:112.30

網膜:-

目:188.10

動脈:-

静脈:66.60

リンパ節:121.30

末梢血:36.40

脾臓:56.70

胸腺:154.60

骨髄:19.70

脂肪:-

骨:76.80

皮膚:67.20

GeneChip

大脳:6.25

小脳:5.58

脳幹:6.15

脳梁:6.46

松果体:-

末梢神経:5.90

脊柱:6.34

網膜:-

目:-

動脈:5.76

静脈:5.66

リンパ節:6.25

末梢血:-

脾臓:6.17

胸腺:6.93

骨髄:6.10

脂肪:5.52

骨:-

皮膚:5.18

CAGE

大脳:4.69

小脳:-

脳幹:4.58

脳梁:4.91

松果体:4.57

末梢神経:-

脊柱:4.96

網膜:-

目:-

動脈:4.06

静脈:4.02

リンパ節:4.15

末梢血:-

脾臓:4.03

胸腺:5.05

骨髄:-

脂肪:4.01

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.95

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.69

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.19

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:45.60

胎盤:29.10

前立腺:67.60

卵巣:37.30

精巣:108.20

心臓:127.70

骨格筋:60.30

食道:-

胃:63.70

腸:32.40

結腸:67.80

肝臓:63.30

肺:63.50

膀胱:-

腎臓:93.60

下垂体:-

甲状腺:327.50

副腎:-

膵臓:186.70

乳腺:139.40

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.69

胎盤:5.15

前立腺:5.54

卵巣:6.12

精巣:6.94

心臓:6.01

骨格筋:5.07

食道:5.58

胃:5.89

腸:5.23

結腸:5.39

肝臓:5.67

肺:5.81

膀胱:-

腎臓:6

下垂体:6.60

甲状腺:6.33

副腎:6.27

膵臓:5.33

乳腺:5.98

唾液腺:5.15

CAGE

子宮:4.22

胎盤:3.95

前立腺:4.11

卵巣:4.68

精巣:4.47

心臓:4.25

骨格筋:3.87

食道:3.92

胃:-

腸:3.54

結腸:3.70

肝臓:3.71

肺:3.77

膀胱:3.86

腎臓:4.23

下垂体:4.82

甲状腺:4.26

副腎:-

膵臓:3.71

乳腺:3.58

唾液腺:4.16

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.34

卵巣:4.26

精巣:3.80

心臓:2.75

骨格筋:0.95

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.75

肝臓:0.74

肺:2.16

膀胱:-

腎臓:2.56

下垂体:-

甲状腺:3.50

副腎:3.47

膵臓:-

乳腺:3.22

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_012117
Gene ID	23468
Unigene ID	Hs.349283
Probe set ID	209715_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000094916
GTEx ID	ENSG00000094916

オーソログ対応遺伝子

マウス[12]	NM_001076789, NM_001110216, NM_007626
ラット[1]	NM_001106797, NM_001110216, NM_007626

染色体

12q13.13 [54,624,724 - 54,673,955]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000953	Chromo domain
IPR017984	Chromo domain subgroup
IPR016197	Chromo domain-like
IPR008251	Chromo shadow
IPR018125	Chromo shadow, subgroup

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007596	blood coagulation
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0019048	virus-host interaction

Cellular Component

GO:0010369	chromocenter
GO:0005737	cytoplasm
GO:0000118	histone deacetylase complex
GO:0035097	histone methyltransferase complex
GO:0000776	kinetochore
GO:0031618	nuclear centromeric heterochromatin
GO:0005635	nuclear envelope
GO:0005720	nuclear heterochromatin
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0016605	PML body
GO:0017053	transcriptional repressor complex

Molecular Function

GO:0003682	chromatin binding
GO:0019899	enzyme binding
GO:0042826	histone deacetylase binding
GO:0035064	methylated histone residue binding
GO:0005515	protein binding
GO:0030674	protein binding, bridging
GO:0042803	protein homodimerization activity
GO:0070491	transcription repressor binding

chromobox homolog 5 (HP1 alpha homolog, Drosophila)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function