superkiller viralicidic activity 2-like 2 (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

MGC142069, SKIV2L2, Dob1, ATP-dependent helicase SKIV2L2, Superkiller viralicidic activity 2-like 2, KIAA0052, Mtr4

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:117.30

小脳:163.70

脳幹:-

脳梁:145.80

松果体:148.30

末梢神経:30.70

脊柱:112.30

網膜:118.60

目:41.10

動脈:89.90

静脈:-

リンパ節:80.90

末梢血:36.40

脾臓:94.50

胸腺:167.50

骨髄:59

脂肪:-

骨:127.90

皮膚:86.40

GeneChip

大脳:7.10

小脳:7.23

脳幹:7.36

脳梁:7.12

松果体:-

末梢神経:7.13

脊柱:7.05

網膜:-

目:-

動脈:7.14

静脈:6.80

リンパ節:7.09

末梢血:-

脾臓:6.86

胸腺:8.14

骨髄:6.80

脂肪:7.24

骨:-

皮膚:7.36

CAGE

大脳:4.41

小脳:-

脳幹:4.24

脳梁:3.99

松果体:5.25

末梢神経:-

脊柱:4.89

網膜:-

目:-

動脈:4.21

静脈:3.88

リンパ節:4.01

末梢血:-

脾臓:4.22

胸腺:4.43

骨髄:-

脂肪:4.19

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.82

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.84

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.16

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:200.50

胎盤:94.70

前立腺:157.70

卵巣:74.50

精巣:302.90

心臓:63.90

骨格筋:80.40

食道:685.60

胃:21.20

腸:-

結腸:42.40

肝臓:63.30

肺:268.80

膀胱:-

腎臓:52

下垂体:116

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:88.90

乳腺:111.50

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.72

胎盤:6.95

前立腺:7.85

卵巣:7.75

精巣:8.15

心臓:7.12

骨格筋:7.58

食道:7.11

胃:6.84

腸:7.17

結腸:6.45

肝臓:6.74

肺:6.98

膀胱:-

腎臓:6.59

下垂体:7.20

甲状腺:7.17

副腎:6.96

膵臓:6.81

乳腺:7.11

唾液腺:6.71

CAGE

子宮:4.22

胎盤:4.08

前立腺:4.13

卵巣:4.34

精巣:4.44

心臓:4.49

骨格筋:4.98

食道:4.22

胃:-

腸:4.20

結腸:4.10

肝臓:3.93

肺:4.24

膀胱:4.41

腎臓:4.12

下垂体:4.92

甲状腺:4.16

副腎:-

膵臓:3.90

乳腺:4.44

唾液腺:3.67

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.33

卵巣:4.60

精巣:5.19

心臓:3.78

骨格筋:4.53

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.14

肝臓:3.16

肺:3.70

膀胱:-

腎臓:4.01

下垂体:-

甲状腺:4.69

副腎:3.98

膵臓:-

乳腺:3.94

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_015360
Gene ID	23517
Unigene ID	Hs.274531
Probe set ID	212896_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000039123
GTEx ID	ENSG00000039123

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_028151
ラット[1]	NM_028151

染色体

5q11.2 [54,603,588 - 54,721,409]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001	DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021	Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0000460	maturation of 5.8S rRNA
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome

Cellular Component

GO:0071013	catalytic step 2 spliceosome
GO:0000178	exosome (RNase complex)
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0008026	ATP-dependent helicase activity
GO:0003676	nucleic acid binding
GO:0005515	protein binding

superkiller viralicidic activity 2-like 2 (S. cerevisiae)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function