DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 58

同義遺伝子名

Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, DKFZp686N19181, RIG-I, RIG-1, DKFZp434J1111, DEAD-box protein 58, Retinoic acid-inducible gene 1 protein, FLJ13599, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 58, DDX58

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:10.70

小脳:25.20

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:-

網膜:-

目:5.90

動脈:60

静脈:-

リンパ節:20.20

末梢血:18.20

脾臓:37.80

胸腺:77.30

骨髄:-

脂肪:40.30

骨:38.40

皮膚:52.80

GeneChip

大脳:4.03

小脳:3.97

脳幹:4.22

脳梁:4.12

松果体:-

末梢神経:4.62

脊柱:4.17

網膜:-

目:-

動脈:4.59

静脈:4.82

リンパ節:5.20

末梢血:-

脾臓:5.07

胸腺:5.76

骨髄:4.66

脂肪:4.78

骨:-

皮膚:5.01

CAGE

大脳:2.24

小脳:-

脳幹:2.58

脳梁:2.36

松果体:2.41

末梢神経:-

脊柱:2.80

網膜:-

目:-

動脈:2.78

静脈:3.10

リンパ節:3.00

末梢血:-

脾臓:3.19

胸腺:3.89

骨髄:-

脂肪:3.90

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.34

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.39

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.43

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:82

胎盤:40.10

前立腺:45.10

卵巣:37.30

精巣:30.30

心臓:51.10

骨格筋:-

食道:-

胃:42.50

腸:64.80

結腸:17

肝臓:21.10

肺:44

膀胱:376.80

腎臓:31.20

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:-

乳腺:158

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.11

胎盤:4.86

前立腺:4.52

卵巣:5.11

精巣:3.95

心臓:4.48

骨格筋:4.30

食道:4.51

胃:4.63

腸:4.60

結腸:4.32

肝臓:4.95

肺:5.42

膀胱:-

腎臓:4.36

下垂体:4.26

甲状腺:4.27

副腎:4.53

膵臓:4.74

乳腺:4.89

唾液腺:4.21

CAGE

子宮:3.09

胎盤:3.17

前立腺:3.10

卵巣:2.75

精巣:2.36

心臓:2.76

骨格筋:2.03

食道:2.76

胃:-

腸:3.32

結腸:2.46

肝臓:2.45

肺:3.29

膀胱:2.46

腎臓:3.20

下垂体:2.65

甲状腺:3.07

副腎:-

膵臓:2.54

乳腺:3.02

唾液腺:2.31

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.46

卵巣:2.62

精巣:2.12

心臓:1.52

骨格筋:1.07

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.81

肝臓:1.32

肺:2.36

膀胱:-

腎臓:2.38

下垂体:-

甲状腺:1.99

副腎:2.50

膵臓:-

乳腺:2.24

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_014314
Gene ID	23586
Unigene ID	Hs.190622
Probe set ID	218943_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000107201
GTEx ID	ENSG00000107201

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_172689
ラット[1]	NM_001106645

染色体

9p21.1 [32,455,300 - 32,526,322]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001	DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021	Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0009597	detection of virus
GO:0045087	innate immune response
GO:0032480	negative regulation of type I interferon production
GO:0002230	positive regulation of defense response to virus by host
GO:0032727	positive regulation of interferon-alpha production
GO:0032728	positive regulation of interferon-beta production
GO:0051091	positive regulation of transcription factor activity
GO:0042993	positive regulation of transcription factor import into nucleus
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0030334	regulation of cell migration
GO:0034344	regulation of type III interferon production
GO:0043330	response to exogenous dsRNA
GO:0009615	response to virus
GO:0019048	virus-host interaction

Cellular Component

GO:0015629	actin cytoskeleton
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0032587	ruffle membrane
GO:0005923	tight junction

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0008026	ATP-dependent helicase activity
GO:0003690	double-stranded DNA binding
GO:0003725	double-stranded RNA binding
GO:0042802	identical protein binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003727	single-stranded RNA binding
GO:0008270	zinc ion binding

DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 58

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function