interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 5

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同義遺伝子名

RI58, IFIT-5, IFIT5

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:35.60 小脳:37.80 脳幹:- 脳梁:87.50 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:118.60 目:11.80 動脈:30 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:18.90 胸腺:25.80 骨髄:- 脂肪:- 骨:38.40 皮膚:28.80
GeneChip 大脳:6.56 小脳:7.09 脳幹:6.67 脳梁:6.52 松果体:- 末梢神経:7.07 脊柱:6.73 網膜:- 目:- 動脈:6.55 静脈:6.41 リンパ節:6.47 末梢血:- 脾臓:6.68 胸腺:6.19 骨髄:6.13 脂肪:6.50 骨:- 皮膚:6.30
CAGE 大脳:3.17 小脳:- 脳幹:3.55 脳梁:3.19 松果体:2.98 末梢神経:- 脊柱:3.33 網膜:- 目:- 動脈:2.89 静脈:2.82 リンパ節:3.11 末梢血:- 脾臓:3.67 胸腺:2.98 骨髄:- 脂肪:4.00 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.23 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.31 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.36 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:36.50 胎盤:54.60 前立腺:56.30 卵巣:- 精巣:216.30 心臓:25.50 骨格筋:- 食道:- 胃:85 腸:64.80 結腸:17     肝臓:10.60        肺:48.90    膀胱:- 腎臓:31.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:8.90 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.63 胎盤:6.05 前立腺:6.40 卵巣:6.52 精巣:5.74 心臓:6.27 骨格筋:5.73 食道:5.83 胃:6.24 腸:6.12 結腸:6.11 肝臓:6.24 肺:6.53 膀胱:- 腎臓:6.30 下垂体:6.40 甲状腺:6.46 副腎:6.60 膵臓:6.03 乳腺:6.59 唾液腺:5.59
CAGE 子宮:3.28 胎盤:3.06 前立腺:3.32 卵巣:3.48 精巣:2.50 心臓:3.11 骨格筋:1.88 食道:3.26 胃:- 腸:3.18 結腸:2.78     肝臓:3.09    肺:3.75 膀胱:3.35 腎臓:3.05 下垂体:3.15 甲状腺:3.37 副腎:- 膵臓:2.60 乳腺:3.35 唾液腺:2.31
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.13 卵巣:3.37 精巣:3.05 心臓:1.93 骨格筋:1.31 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.44     肝臓:2.46        肺:3.60    膀胱:- 腎臓:2.96 下垂体:- 甲状腺:2.85 副腎:3.34 膵臓:- 乳腺:2.97 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_012420
Gene ID 24138
Unigene ID Hs.252839
Probe set ID 203596_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000152778
GTEx ID ENSG00000152778

オーソログ対応遺伝子

マウス [0]  
ラット [0]  

染色体

10q23.31  [91,174,343  -  91,180,758]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR019734  Tetratricopeptide repeat

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9398535
12477932
15489334
16009940
16169070
16385451
19322201
19615732
21139048
21163940
21642987
23317505
23334420
23602568
23774268
24250222
24311583
24654937
24778252

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0051607  defense response to virus
GO:0045087  innate immune response

Cellular Component

GO:0015629  actin cytoskeleton
GO:0045177  apical part of cell
GO:0032587  ruffle membrane

Molecular Function

GO:0003723  RNA binding
GO:0003727  single-stranded RNA binding
GO:0000049  tRNA binding