PRP6 pre-mRNA processing factor 6 homolog (S. cerevisiae)

同義遺伝子名

ANT-1, bB152O15.1, hPrp6, chromosome 20 open reading frame 14, U5 snRNP-associated 102 kDa protein, U5-102K, PRPF6, U5-102 kDa protein, TOM, C20orf14, Pre-mRNA-processing factor 6 homolog

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:4.70

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:109.30

脾臓:37.80

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:12.80

皮膚:-

GeneChip

大脳:7.78

小脳:8.25

脳幹:7.78

脳梁:7.87

松果体:-

末梢神経:7.82

脊柱:7.68

網膜:-

目:-

動脈:8.07

静脈:7.86

リンパ節:7.90

末梢血:-

脾臓:7.82

胸腺:8.05

骨髄:7.67

脂肪:7.80

骨:-

皮膚:8.17

CAGE

大脳:4.70

小脳:-

脳幹:4.48

脳梁:4.89

松果体:4.55

末梢神経:-

脊柱:4.52

網膜:-

目:-

動脈:4.64

静脈:4.60

リンパ節:4.52

末梢血:-

脾臓:4.44

胸腺:4.69

骨髄:-

脂肪:4.35

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:4.36

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.28

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.94

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:8.50

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.76

胎盤:7.28

前立腺:8.01

卵巣:8.19

精巣:8.40

心臓:7.31

骨格筋:7.75

食道:8.01

胃:7.61

腸:7.50

結腸:7.56

肝臓:7.39

肺:7.84

膀胱:-

腎臓:7.71

下垂体:8

甲状腺:8.07

副腎:7.66

膵臓:7.46

乳腺:8.23

唾液腺:7.58

CAGE

子宮:4.66

胎盤:4.40

前立腺:4.50

卵巣:4.72

精巣:4.80

心臓:4.33

骨格筋:4.77

食道:4.26

胃:-

腸:4.36

結腸:4.33

肝臓:3.99

肺:4.24

膀胱:4.49

腎臓:4.31

下垂体:4.59

甲状腺:4.33

副腎:-

膵臓:4.41

乳腺:4.27

唾液腺:4.40

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.96

卵巣:5.29

精巣:5.45

心臓:3.41

骨格筋:5.05

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.46

肝臓:3.24

肺:3.90

膀胱:-

腎臓:4.29

下垂体:-

甲状腺:5.19

副腎:4.55

膵臓:-

乳腺:4.71

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_012469
Gene ID	24148
Unigene ID	Hs.313343
Probe set ID	208880_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000101161
GTEx ID	ENSG00000101161

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_133701
ラット[1]	NM_001079766

染色体

20q13.33 [62,612,488 - 62,664,453]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR019734

Tetratricopeptide repeat

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0000244	assembly of spliceosomal tri-snRNP
GO:0010467	gene expression
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006403	RNA localization
GO:0008380	RNA splicing
GO:0000375	RNA splicing, via transesterification reactions
GO:0000245	spliceosome assembly

Cellular Component

GO:0071013	catalytic step 2 spliceosome
GO:0016607	nuclear speck
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0005681	spliceosomal complex
GO:0071001	U4/U6 snRNP
GO:0046540	U4/U6 x U5 tri-snRNP complex
GO:0005682	U5 snRNP

Molecular Function

GO:0050681	androgen receptor binding
GO:0005515	protein binding
GO:0043021	ribonucleoprotein binding
GO:0003723	RNA binding
GO:0003713	transcription coactivator activity

PRP6 pre-mRNA processing factor 6 homolog (S. cerevisiae)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function