WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2

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同義遺伝子名

FLJ12979, FLJ14217, DKFZP434J154, WIPI2, WIPI-2, WIPI49-like protein 2, CGI-50, DKFZp686P02188, WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2, Atg21, FLJ42984

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:105.50 小脳:25.20 脳幹:- 脳梁:58.30 松果体:148.30 末梢神経:122.70 脊柱:- 網膜:- 目:117.50 動脈:- 静脈:- リンパ節:121.30 末梢血:91.10 脾臓:75.60 胸腺:12.90 骨髄:78.70 脂肪:80.70 骨:64 皮膚:124.80
GeneChip 大脳:6.30 小脳:6.47 脳幹:6.02 脳梁:6.44 松果体:- 末梢神経:6.42 脊柱:6.34 網膜:- 目:- 動脈:6.09 静脈:6.26 リンパ節:6.08 末梢血:- 脾臓:6.18 胸腺:6.14 骨髄:6.73 脂肪:6.39 骨:- 皮膚:6.18
CAGE 大脳:3.95 小脳:- 脳幹:3.65 脳梁:3.75 松果体:3.65 末梢神経:- 脊柱:3.71 網膜:- 目:- 動脈:3.63 静脈:3.50 リンパ節:3.44 末梢血:- 脾臓:3.29 胸腺:3.49 骨髄:- 脂肪:3.32 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.89 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.98 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.98 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:82 胎盤:127.50 前立腺:169 卵巣:37.30 精巣:177.40 心臓:204.30 骨格筋:20.10 食道:- 胃:42.50 腸:- 結腸:67.80     肝臓:126.70        肺:92.90    膀胱:- 腎臓:83.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:115.60 乳腺:111.50 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.05 胎盤:6.11 前立腺:5.89 卵巣:6.10 精巣:6.11 心臓:6.26 骨格筋:6.28 食道:6.19 胃:6.06 腸:6.13 結腸:6.45 肝臓:6.34 肺:6.03 膀胱:- 腎臓:6.27 下垂体:6.42 甲状腺:6.14 副腎:6.10 膵臓:6.36 乳腺:6.18 唾液腺:5.96
CAGE 子宮:3.39 胎盤:3.52 前立腺:3.30 卵巣:3.02 精巣:4.19 心臓:3.61 骨格筋:3.37 食道:3.34 胃:- 腸:3.11 結腸:3.36     肝臓:3.30    肺:3.56 膀胱:3.16 腎臓:3.24 下垂体:3.42 甲状腺:3.49 副腎:- 膵臓:3.65 乳腺:3.45 唾液腺:3.56
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.42 卵巣:2.40 精巣:3.35 心臓:2.17 骨格筋:2.20 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.48     肝臓:2.33        肺:2.23    膀胱:- 腎臓:2.24 下垂体:- 甲状腺:3.06 副腎:2.74 膵臓:- 乳腺:2.73 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_016003
Gene ID 26100
Unigene ID Hs.122363
Probe set ID 214699_x_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000157954
GTEx ID ENSG00000157954

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_178398
ラット[1]  NM_001007615

染色体

7p22.1  [5,229,819  -  5,273,457]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001680  WD40 repeat

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9847074
10810093
11076863
11230166
11256614
12477932
12853948
14702039
15489334
15489336
15602573
16169070
16381901
18029348
20505359
20562859
21044950
21139048
21145461
21564513
21906983
21963094
22505724
22939629
24250222

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0000045  autophagic vacuole formation
GO:0000046  autophagic vacuole fusion

Cellular Component

GO:0005776  autophagic vacuole
GO:0000421  autophagic vacuole membrane
GO:0005737  cytoplasm
GO:0005829  cytosol
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus
GO:0034045  pre-autophagosomal structure membrane
GO:0043234  protein complex

Molecular Function

GO:0032266  phosphatidylinositol 3-phosphate binding
GO:0080025  phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding
GO:0005515  protein binding