LIM homeobox 6

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同義遺伝子名

MGC119545, Lhx6, LIM homeobox 6, LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6.1, MGC119542, MGC119544, LHX6.1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:54.50 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:6.31 小脳:5.67 脳幹:5.62 脳梁:5.64 松果体:- 末梢神経:5.72 脊柱:5.74 網膜:- 目:- 動脈:6.25 静脈:6.42 リンパ節:5.75 末梢血:- 脾臓:5.24 胸腺:5.67 骨髄:5.65 脂肪:6.59 骨:- 皮膚:6.40
CAGE 大脳:2.21 小脳:- 脳幹:0.75 脳梁:0.99 松果体:0 末梢神経:- 脊柱:0.55 網膜:- 目:- 動脈:1.75 静脈:2.39 リンパ節:0.71 末梢血:- 脾臓:0.09 胸腺:0.18 骨髄:- 脂肪:2.80 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.78 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.37 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.44 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:54.70 胎盤:3.60 前立腺:- 卵巣:37.30 精巣:8.70 心臓:51.10 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:32.40 結腸:-     肝臓:-        肺:4.90    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:9.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.01 胎盤:5.78 前立腺:5.82 卵巣:5.86 精巣:6.15 心臓:6.40 骨格筋:5.92 食道:5.84 胃:6.13 腸:6.19 結腸:6.02 肝臓:5.56 肺:6.32 膀胱:- 腎臓:5.66 下垂体:5.58 甲状腺:5.77 副腎:5.43 膵臓:6.27 乳腺:6.09 唾液腺:5.96
CAGE 子宮:1.43 胎盤:0.92 前立腺:1.53 卵巣:1.27 精巣:2.25 心臓:2.04 骨格筋:1.22 食道:1.77 胃:- 腸:1.05 結腸:0.74     肝臓:0.46    肺:1.71 膀胱:1.21 腎臓:0.58 下垂体:0.40 甲状腺:1.50 副腎:- 膵臓:0 乳腺:2.79 唾液腺:0.62
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.94 卵巣:0.20 精巣:0.23 心臓:0.49 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.64     肝臓:0.00        肺:0.33    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:0.28 副腎:1.17 膵臓:- 乳腺:1.06 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_199160
Gene ID 26468
Unigene ID Hs.103137
Probe set ID 219884_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000106852
GTEx ID ENSG00000106852

オーソログ対応遺伝子

マウス[8]  NM_001083125, NM_001083126, NM_001083127, NM_008500
ラット[1]  NM_001107837, NM_001083126, NM_001083127, NM_008500

染色体

9q33.2  [124,964,856  -  124,991,220]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356  Homeobox
IPR009057  Homeodomain-like
IPR012287  Homeodomain-related

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10393337
11076863
11230166
11256614
12477932
14702039
15164053
15489334
15489336
16344560
16381901
16732332
20201926
20379614
20428825
21240459
22435649
23229549
24157876

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0048469  cell maturation
GO:0021853  cerebral cortex GABAergic interneuron migration
GO:0021799  cerebral cortex radially oriented cell migration
GO:0021800  cerebral cortex tangential migration
GO:0021884  forebrain neuron development
GO:0021877  forebrain neuron fate commitment
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0043565  sequence-specific DNA binding
GO:0003700  transcription factor activity
GO:0008270  zinc ion binding