protocadherin 17

詳細情報を見る

同義遺伝子名

PCDH17, Protocadherin-68, PCDH68, protocadherin 17, Protocadherin-17 precursor, PCH68

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:68.70

小脳:37.80

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:61.30

脊柱:112.30

網膜:-

目:11.80

動脈:30

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:94.50

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:14.40

GeneChip

大脳:8.56

小脳:7.24

脳幹:8.39

脳梁:8.39

松果体:-

末梢神経:7.26

脊柱:8.03

網膜:-

目:-

動脈:6.54

静脈:6.71

リンパ節:6.08

末梢血:-

脾臓:9.88

胸腺:5.26

骨髄:6.24

脂肪:6.11

骨:-

皮膚:5.79

CAGE

大脳:2.47

小脳:-

脳幹:2.60

脳梁:2.81

松果体:0.83

末梢神経:-

脊柱:2.53

網膜:-

目:-

動脈:1.38

静脈:0.96

リンパ節:0.12

末梢血:-

脾臓:3.69

胸腺:0.18

骨髄:-

脂肪:1.41

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.26

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.67

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.81

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:9.10

胎盤:21.90

前立腺:-

卵巣:111.80

精巣:56.20

心臓:51.10

骨格筋:-

食道:-

胃:63.70

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:34.20

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:106.70

乳腺:9.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.66

胎盤:5.76

前立腺:6.25

卵巣:6.46

精巣:8.32

心臓:6.42

骨格筋:5.93

食道:5.94

胃:6.83

腸:6.30

結腸:6.29

肝臓:6

肺:8.13

膀胱:-

腎臓:5.94

下垂体:6.45

甲状腺:6.41

副腎:6.58

膵臓:6.58

乳腺:5.93

唾液腺:5.56

CAGE

子宮:1.63

胎盤:0.81

前立腺:0.88

卵巣:0.98

精巣:1.02

心臓:1.16

骨格筋:0.88

食道:1.44

胃:-

腸:0.57

結腸:0.38

肝臓:0.63

肺:2.55

膀胱:1.45

腎臓:0.74

下垂体:0.83

甲状腺:0.82

副腎:-

膵臓:1.59

乳腺:1.36

唾液腺:0.36

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.74

卵巣:1.20

精巣:2.67

心臓:0.71

骨格筋:0.24

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.78

肝臓:0.36

肺:5.71

膀胱:-

腎臓:1.03

下垂体:-

甲状腺:1.04

副腎:2.17

膵臓:-

乳腺:0.68

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001040429
Gene ID	27253
Unigene ID	Hs.106511
Probe set ID	205656_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000118946
GTEx ID	ENSG00000118946

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_001013753
ラット[1]	NM_001107279

染色体

13q21.1 [58,205,944 - 58,303,445]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002126	Cadherin
IPR015919	Cadherin-like

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

homophilic cell adhesion

Cellular Component

GO:0016021	integral to membrane
GO:0005886	plasma membrane

Molecular Function

GO:0005509	calcium ion binding
GO:0005515	protein binding