RNA binding motif protein, X-linked

同義遺伝子名

RNA binding motif protein, X-linked, RNA-binding motif protein, X chromosome, RBMXRT, HNRPG, RNMX, hnRNP G, Glycoprotein p43, RBMXP1, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein G, RBMX

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:156.40

小脳:88.20

脳幹:-

脳梁:87.50

松果体:148.30

末梢神経:306.70

脊柱:224.60

網膜:118.60

目:146.90

動脈:269.80

静脈:133.30

リンパ節:131.40

末梢血:91.10

脾臓:151.30

胸腺:231.90

骨髄:98.40

脂肪:161.30

骨:179.10

皮膚:211.20

GeneChip

大脳:7.72

小脳:8.11

脳幹:7.60

脳梁:8.19

松果体:-

末梢神経:8.03

脊柱:8.03

網膜:-

目:-

動脈:8.30

静脈:8.33

リンパ節:8.52

末梢血:-

脾臓:8.29

胸腺:9.35

骨髄:8.48

脂肪:8.31

骨:-

皮膚:7.85

CAGE

大脳:4.48

小脳:-

脳幹:4.09

脳梁:4.51

松果体:4.47

末梢神経:-

脊柱:4.66

網膜:-

目:-

動脈:4.98

静脈:4.81

リンパ節:4.85

末梢血:-

脾臓:3.93

胸腺:5.05

骨髄:-

脂肪:3.65

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:4.36

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.17

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.72

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:319

胎盤:160.30

前立腺:33.80

卵巣:149.10

精巣:95.20

心臓:140.50

骨格筋:80.40

食道:-

胃:85

腸:162

結腸:135.70

肝臓:380

肺:185.70

膀胱:125.60

腎臓:218.30

下垂体:116

甲状腺:327.50

副腎:101.60

膵臓:71.10

乳腺:297.40

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.94

胎盤:7.58

前立腺:8.41

卵巣:9.36

精巣:7.45

心臓:7.97

骨格筋:8.31

食道:8.07

胃:8.09

腸:8.34

結腸:8.23

肝臓:7.41

肺:8.43

膀胱:-

腎臓:7.98

下垂体:7.82

甲状腺:8.60

副腎:7.99

膵臓:8.61

乳腺:8.50

唾液腺:8.13

CAGE

子宮:4.63

胎盤:3.32

前立腺:4.15

卵巣:4.38

精巣:4.25

心臓:4.14

骨格筋:4.70

食道:3.67

胃:-

腸:3.91

結腸:4.46

肝臓:3.42

肺:4.37

膀胱:4.22

腎臓:3.75

下垂体:4.47

甲状腺:4.36

副腎:-

膵臓:4.15

乳腺:4.81

唾液腺:4.10

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:5.49

卵巣:5.58

精巣:4.44

心臓:3.95

骨格筋:5.66

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:5.08

肝臓:3.18

肺:4.01

膀胱:-

腎臓:4.51

下垂体:-

甲状腺:5.32

副腎:4.90

膵臓:-

乳腺:4.23

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_002139
Gene ID	27316
Unigene ID	Hs.380118
Probe set ID	213762_x_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000147274
GTEx ID	ENSG00000147274

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_001166623, NM_011252
ラット[4]	NM_001166623, NM_011252

染色体

Xq26.3 [135,951,351 - 135,962,939]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504	RNA recognition motif, RNP-1
IPR003954	RNA recognition, domain 1

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0071347	cellular response to interleukin-1
GO:0010467	gene expression
GO:0006509	membrane protein ectodomain proteolysis
GO:0048025	negative regulation of nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0048026	positive regulation of nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0051260	protein homooligomerization
GO:0000381	regulation of alternative nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0008380	RNA splicing
GO:0006366	transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

GO:0071013	catalytic step 2 spliceosome
GO:0070062	extracellular vesicular exosome
GO:0005719	nuclear euchromatin
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0003682	chromatin binding
GO:0003729	mRNA binding
GO:0000166	nucleotide binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding

RNA binding motif protein, X-linked

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function