mutS homolog 6 (E. coli)

同義遺伝子名

mutS (E. coli) homolog 6, MSH6, DNA mismatch repair protein MSH6, mutS homolog 6 (E. coli), HSAP, HNPCC5, GTMBP, GTBP, MutS-alpha 160 kDa subunit, p160, G/T mismatch-binding protein

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:49.80

小脳:63

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:112.30

網膜:-

目:164.60

動脈:30

静脈:66.60

リンパ節:80.90

末梢血:-

脾臓:56.70

胸腺:64.40

骨髄:19.70

脂肪:121

骨:25.60

皮膚:52.80

GeneChip

大脳:6.68

小脳:6.48

脳幹:6.80

脳梁:7.36

松果体:-

末梢神経:6.89

脊柱:6.98

網膜:-

目:-

動脈:6.95

静脈:6.66

リンパ節:7.02

末梢血:-

脾臓:6.72

胸腺:8.15

骨髄:7.19

脂肪:6.87

骨:-

皮膚:6.87

CAGE

大脳:3.42

小脳:-

脳幹:3.81

脳梁:3.76

松果体:3.12

末梢神経:-

脊柱:3.47

網膜:-

目:-

動脈:3.34

静脈:3.46

リンパ節:3.32

末梢血:-

脾臓:3.16

胸腺:4.37

骨髄:-

脂肪:3.49

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.42

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.37

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.32

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:63.80

胎盤:58.30

前立腺:22.50

卵巣:37.30

精巣:190.40

心臓:114.90

骨格筋:40.20

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:17

肝臓:52.80

肺:78.20

膀胱:-

腎臓:31.20

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:35.60

乳腺:74.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.90

胎盤:6.78

前立腺:7.58

卵巣:8.26

精巣:8.33

心臓:6.44

骨格筋:6.52

食道:6.65

胃:6.77

腸:6.64

結腸:6.25

肝臓:6.73

肺:6.96

膀胱:-

腎臓:6.16

下垂体:6.72

甲状腺:7.11

副腎:7.54

膵臓:7.28

乳腺:7.18

唾液腺:6.41

CAGE

子宮:4.06

胎盤:3.34

前立腺:3.63

卵巣:4.06

精巣:4.07

心臓:3.15

骨格筋:2.45

食道:3.42

胃:-

腸:2.67

結腸:3.17

肝臓:3.40

肺:3.21

膀胱:3.56

腎臓:2.91

下垂体:3.60

甲状腺:3.38

副腎:-

膵臓:4.07

乳腺:3.35

唾液腺:3.17

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.78

卵巣:4.79

精巣:4.92

心臓:2.42

骨格筋:2.91

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.46

肝臓:2.52

肺:3.21

膀胱:-

腎臓:3.12

下垂体:-

甲状腺:3.80

副腎:3.45

膵臓:-

乳腺:3.30

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000179
Gene ID	2956
Unigene ID	Hs.445052
Probe set ID	202911_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000116062
GTEx ID	ENSG00000116062

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_010830
ラット[1]	NM_010830

染色体

2p16.3 [48,010,221 - 48,034,092]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000432

DNA mismatch repair protein MutS, C-terminal

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006200	ATP catabolic process
GO:0008340	determination of adult lifespan
GO:0008630	DNA damage response, signal transduction resulting in induction of apoptosis
GO:0006281	DNA repair
GO:0045190	isotype switching
GO:0043570	maintenance of DNA repeat elements
GO:0000710	meiotic mismatch repair
GO:0006298	mismatch repair
GO:0045910	negative regulation of DNA recombination
GO:0051096	positive regulation of helicase activity
GO:0007131	reciprocal meiotic recombination
GO:0009411	response to UV
GO:0016446	somatic hypermutation of immunoglobulin genes
GO:0016447	somatic recombination of immunoglobulin gene segments

Cellular Component

GO:0032301	MutSalpha complex
GO:0000790	nuclear chromatin
GO:0000228	nuclear chromosome

Molecular Function

GO:0043531	ADP binding
GO:0005524	ATP binding
GO:0016887	ATPase activity
GO:0003682	chromatin binding
GO:0008094	DNA-dependent ATPase activity
GO:0003690	double-stranded DNA binding
GO:0000400	four-way junction DNA binding
GO:0032137	guanine/thymine mispair binding
GO:0000287	magnesium ion binding
GO:0035064	methylated histone residue binding
GO:0030983	mismatched DNA binding
GO:0032405	MutLalpha complex binding
GO:0032357	oxidized purine DNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0042803	protein homodimerization activity
GO:0032142	single guanine insertion binding
GO:0032143	single thymine insertion binding

mutS homolog 6 (E. coli)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function