general transcription factor IIH, polypeptide 4, 52kDa

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同義遺伝子名

BTF2-p52, General transcription factor IIH polypeptide 4, GTF2H4, Basic transcription factor 52 kDa subunit

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:28.40 小脳:- 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:52.90 動脈:30 静脈:- リンパ節:50.60 末梢血:36.40 脾臓:18.90 胸腺:38.70 骨髄:- 脂肪:- 骨:25.60 皮膚:14.40
GeneChip 大脳:5.27 小脳:5.59 脳幹:5.15 脳梁:5.06 松果体:- 末梢神経:5.34 脊柱:4.85 網膜:- 目:- 動脈:5.80 静脈:5.25 リンパ節:5.42 末梢血:- 脾臓:5.80 胸腺:6.48 骨髄:5.21 脂肪:5.38 骨:- 皮膚:5.66
CAGE 大脳:3.42 小脳:- 脳幹:2.94 脳梁:3.03 松果体:3.25 末梢神経:- 脊柱:3.59 網膜:- 目:- 動脈:2.96 静脈:3.01 リンパ節:2.96 末梢血:- 脾臓:2.82 胸腺:3.12 骨髄:- 脂肪:2.71 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:27.30 胎盤:40.10 前立腺:56.30 卵巣:74.50 精巣:13 心臓:- 骨格筋:20.10 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:17     肝臓:-        肺:24.40    膀胱:- 腎臓:52 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:35.60 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.94 胎盤:5.09 前立腺:5.90 卵巣:5.88 精巣:6 心臓:5.15 骨格筋:5.29 食道:5.83 胃:5.44 腸:5.40 結腸:5.61 肝臓:6.35 肺:5.44 膀胱:- 腎臓:5.71 下垂体:5.85 甲状腺:5.65 副腎:5.37 膵臓:5.34 乳腺:5.83 唾液腺:4.82
CAGE 子宮:3.01 胎盤:2.58 前立腺:2.71 卵巣:2.85 精巣:2.96 心臓:2.65 骨格筋:2.70 食道:2.84 胃:- 腸:2.60 結腸:3.18     肝臓:3.00    肺:2.94 膀胱:2.51 腎臓:3.18 下垂体:3.21 甲状腺:2.87 副腎:- 膵臓:2.71 乳腺:3.62 唾液腺:2.26
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0 卵巣:0 精巣:0 心臓:0 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0     肝臓:0        肺:0    膀胱:- 腎臓:0 下垂体:- 甲状腺:0 副腎:0 膵臓:- 乳腺:0 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001517
Gene ID 2968
Unigene ID Hs.485070
Probe set ID 203577_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000213780
ENSG00000221974
ENSG00000233149
ENSG00000236895
GTEx ID ENSG00000213780
ENSG00000221974
ENSG00000233149
ENSG00000236895

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]  NM_010364
ラット[1]  NM_212501

染色体

6p21.33  [30,875,961  -  30,881,883]
HSCHR6_MHC_QBL  [30,865,549  -  30,871,471]
HSCHR6_MHC_MANN  [30,920,643  -  30,926,565]
HSCHR6_MHC_MCF  [30,954,519  -  30,960,441]
HSCHR6_MHC_DBB  [30,866,676  -  30,872,598]
HSCHR6_MHC_COX  [30,865,832  -  30,871,754]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1939271
2449431
8125298
8612585
8628270
8692842
8849451
8934526
8946909
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9118947
9121429
9130708
9159119
9184228
9311822
9334327
9405375
9512541
9570510
9582279
9651670
9765201
9790902
9852112
10066804
10082552
10214908
10438593
10583946
10677310
10866664
11062469
11113176
11313499
12080057
12393749
12477932
12590132
12646563
14569024
15220921
15489334
15533047
15601838
16246722
16702430
16874302
17242193
17466625
17466626
17643375
18354501
18391197
18614043
18676829
19681155
19851445
19945377
20522537
20587610
20848476
21139048
21906983
22524621
22623531
22939629
23028341
23602568
23751493
23986795
24250222
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006281  DNA repair
GO:0010467  gene expression
GO:0006370  mRNA capping
GO:0006289  nucleotide-excision repair
GO:0000718  nucleotide-excision repair, DNA damage removal
GO:0050434  positive regulation of viral transcription
GO:0006468  protein amino acid phosphorylation
GO:0006362  RNA elongation from RNA polymerase I promoter
GO:0006368  RNA elongation from RNA polymerase II promoter
GO:0006363  termination of RNA polymerase I transcription
GO:0006360  transcription from RNA polymerase I promoter
GO:0006366  transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006361  transcription initiation from RNA polymerase I promoter
GO:0006367  transcription initiation from RNA polymerase II promoter
GO:0006283  transcription-coupled nucleotide-excision repair
GO:0016032  viral reproduction

Cellular Component

GO:0000439  core TFIIH complex
GO:0005675  holo TFIIH complex
GO:0005654  nucleoplasm

Molecular Function

GO:0004003  ATP-dependent DNA helicase activity
GO:0008094  DNA-dependent ATPase activity
GO:0005515  protein binding
GO:0004672  protein kinase activity
GO:0008353  RNA polymerase II carboxy-terminal domain kinase activity
GO:0003700  transcription factor activity