host cell factor C1 (VP16-accessory protein)

同義遺伝子名

HFC1, VCAF, C1 factor, HCFC1, VP16 accessory protein, HCF, host cell factor C1 (VP16-accessory protein), MGC70925, HCF-1, CFF, Host cell factor, HCF1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:21.30

小脳:12.60

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:-

網膜:-

目:47

動脈:30

静脈:-

リンパ節:91

末梢血:72.90

脾臓:-

胸腺:51.50

骨髄:118.10

脂肪:80.70

骨:12.80

皮膚:52.80

GeneChip

大脳:5.60

小脳:5.64

脳幹:5.63

脳梁:5.52

松果体:-

末梢神経:5.43

脊柱:5.26

網膜:-

目:-

動脈:5.56

静脈:5.96

リンパ節:5.66

末梢血:-

脾臓:5.57

胸腺:5.44

骨髄:5.80

脂肪:5.51

骨:-

皮膚:5.25

CAGE

大脳:3.74

小脳:-

脳幹:3.45

脳梁:3.72

松果体:3.74

末梢神経:-

脊柱:3.97

網膜:-

目:-

動脈:3.90

静脈:3.86

リンパ節:3.81

末梢血:-

脾臓:3.61

胸腺:4.57

骨髄:-

脂肪:3.45

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.32

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.25

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.20

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:9.10

胎盤:25.50

前立腺:101.40

卵巣:260.80

精巣:13

心臓:12.80

骨格筋:40.20

食道:-

胃:63.70

腸:-

結腸:93.30

肝臓:31.70

肺:34.20

膀胱:-

腎臓:41.60

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:71.10

乳腺:167.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.46

胎盤:5.23

前立腺:5.24

卵巣:5.40

精巣:5.21

心臓:5.60

骨格筋:5.66

食道:5.68

胃:5.67

腸:5.73

結腸:5.93

肝臓:5.77

肺:5.44

膀胱:-

腎臓:5.68

下垂体:5.62

甲状腺:5.41

副腎:5.94

膵臓:6.04

乳腺:5.47

唾液腺:5.86

CAGE

子宮:3.66

胎盤:3.42

前立腺:3.17

卵巣:3.66

精巣:3.56

心臓:3.58

骨格筋:3.49

食道:3.34

胃:-

腸:3.32

結腸:3.74

肝臓:3.40

肺:3.70

膀胱:3.14

腎臓:3.23

下垂体:3.59

甲状腺:3.20

副腎:-

膵臓:3.42

乳腺:3.58

唾液腺:4.03

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.79

卵巣:3.62

精巣:3.20

心臓:2.16

骨格筋:2.64

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.47

肝臓:2.08

肺:2.59

膀胱:-

腎臓:2.53

下垂体:-

甲状腺:3.15

副腎:3.19

膵臓:-

乳腺:2.73

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_005334
Gene ID	3054
Unigene ID	Hs.83634
Probe set ID	202473_x_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000172534
GTEx ID	ENSG00000172534

オーソログ対応遺伝子

マウス[6]	NM_008224
ラット[1]	NM_001139507

染色体

Xq28 [153,213,004 - 153,237,258]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003961	Fibronectin, type III
IPR008957	Fibronectin, type III-like fold

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007049	cell cycle
GO:0043984	histone H4-K16 acetylation
GO:0043981	histone H4-K5 acetylation
GO:0043982	histone H4-K8 acetylation
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045787	positive regulation of cell cycle
GO:0010628	positive regulation of gene expression
GO:0050821	protein stabilization
GO:0019046	reactivation of latent virus
GO:0043254	regulation of protein complex assembly
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006366	transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0019048	virus-host interaction

Cellular Component

GO:0005671	Ada2/Gcn5/Ada3 transcription activator complex
GO:0043025	cell soma
GO:0005737	cytoplasm
GO:0000123	histone acetyltransferase complex
GO:0005739	mitochondrion
GO:0071339	MLL1 complex
GO:0070688	MLL5-L complex
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus
GO:0070461	SAGA-type complex
GO:0048188	Set1C/COMPASS complex

Molecular Function

GO:0003682	chromatin binding
GO:0046972	histone acetyltransferase activity (H4-K16 specific)
GO:0043995	histone acetyltransferase activity (H4-K5 specific)
GO:0043996	histone acetyltransferase activity (H4-K8 specific)
GO:0042802	identical protein binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003713	transcription coactivator activity
GO:0003700	transcription factor activity

host cell factor C1 (VP16-accessory protein)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function