major histocompatibility complex, class I, F

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同義遺伝子名

HLAF, HLA F antigen, major histocompatibility complex, class I, F, HLA-F, HLA-CDA12, Leukocyte antigen F, HLA-5.4

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:4.70

小脳:-

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:92

脊柱:-

網膜:-

目:47

動脈:30

静脈:-

リンパ節:495.40

末梢血:145.70

脾臓:264.70

胸腺:25.80

骨髄:19.70

脂肪:80.70

骨:64

皮膚:24

GeneChip

大脳:8.23

小脳:8.08

脳幹:8.34

脳梁:8.76

松果体:-

末梢神経:9.70

脊柱:8.91

網膜:-

目:-

動脈:9.85

静脈:10.20

リンパ節:11.04

末梢血:-

脾臓:11.82

胸腺:10.42

骨髄:10.50

脂肪:10.35

骨:-

皮膚:9.92

CAGE

大脳:2.08

小脳:-

脳幹:2.00

脳梁:1.95

松果体:1.90

末梢神経:-

脊柱:2.47

網膜:-

目:-

動脈:3.59

静脈:4.33

リンパ節:3.97

末梢血:-

脾臓:4.20

胸腺:2.91

骨髄:-

脂肪:2.98

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.71

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:5.32

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:5.31

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:36.50

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:37.30

精巣:-

心臓:12.80

骨格筋:60.30

食道:-

胃:85

腸:194.40

結腸:101.80

肝臓:-

肺:161.30

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:116

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:26.70

乳腺:18.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:10.09

胎盤:9.23

前立腺:9.89

卵巣:9.69

精巣:8.39

心臓:9.76

骨格筋:8.43

食道:9.59

胃:10.34

腸:9.82

結腸:10.68

肝臓:9.78

肺:11.39

膀胱:-

腎臓:9.53

下垂体:9.23

甲状腺:10.09

副腎:9.95

膵臓:8.99

乳腺:10.19

唾液腺:9.42

CAGE

子宮:2.99

胎盤:1.98

前立腺:2.76

卵巣:2.28

精巣:2.05

心臓:3.15

骨格筋:2.15

食道:2.83

胃:-

腸:3.82

結腸:3.39

肝臓:2.71

肺:4.01

膀胱:2.81

腎臓:2.81

下垂体:2.51

甲状腺:2.83

副腎:-

膵臓:2.34

乳腺:2.95

唾液腺:2.43

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.19

卵巣:3.51

精巣:3.48

心臓:3.15

骨格筋:2.33

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.69

肝臓:2.64

肺:6.15

膀胱:-

腎臓:3.84

下垂体:-

甲状腺:3.09

副腎:5.20

膵臓:-

乳腺:4.43

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_018950
Gene ID	3134
Unigene ID	Hs.519972
Probe set ID	221875_x_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000204642
GTEx ID	ENSG00000204642

オーソログ対応遺伝子

マウス [0]
ラット [0]

染色体

HSCHR6_MHC_MANN [29,687,660 - 29,703,415]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_SSTO [29,687,514 - 29,703,210]

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- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_MCF [29,687,668 - 29,690,602]

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- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_DBB [29,688,037 - 29,703,789]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_COX [29,684,537 - 29,700,280]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

6p22.1 [29,690,552 - 29,706,305]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_QBL [29,688,014 - 29,703,770]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001039	MHC class I, alpha chain, alpha1/alpha2
IPR011161	MHC class I-like antigen recognition
IPR011162	MHC classes I/II-like antigen recognition protein

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0042590	antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I
GO:0002479	antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent
GO:0002480	antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-independent
GO:0002474	antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I
GO:0019221	cytokine-mediated signaling pathway
GO:0060333	interferon-gamma-mediated signaling pathway
GO:0001916	positive regulation of T cell mediated cytotoxicity
GO:0050776	regulation of immune response
GO:0060337	type I interferon-mediated signaling pathway

Cellular Component

GO:0031901	early endosome membrane
GO:0012507	ER to Golgi transport vesicle membrane
GO:0000139	Golgi membrane
GO:0042612	MHC class I protein complex
GO:0030670	phagocytic vesicle membrane
GO:0005886	plasma membrane

Molecular Function

GO:0042605

peptide antigen binding

major histocompatibility complex, class I, F

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function