heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U (scaffold attachment factor A)

同義遺伝子名

Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U, hnRNPU, hnRNP U, SAF-A, pp120, U21.1, Scaffold attachment factor A, SAFA, HNRPU, HNRNPU

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:-

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:9.40

小脳:9.95

脳幹:9.38

脳梁:9.75

松果体:-

末梢神経:9.52

脊柱:9.66

網膜:-

目:-

動脈:9.33

静脈:9.33

リンパ節:9.52

末梢血:-

脾臓:9.56

胸腺:10.63

骨髄:9.60

脂肪:9.41

骨:-

皮膚:9.33

CAGE

大脳:5.75

小脳:-

脳幹:5.80

脳梁:5.87

松果体:5.67

末梢神経:-

脊柱:5.74

網膜:-

目:-

動脈:5.78

静脈:5.90

リンパ節:5.71

末梢血:-

脾臓:5.95

胸腺:6.45

骨髄:-

脂肪:5.85

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:5.28

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:5.20

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:5.55

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:7.30

前立腺:-

卵巣:-

精巣:13

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:9.91

胎盤:9.53

前立腺:9.95

卵巣:10.21

精巣:9.68

心臓:9.25

骨格筋:8.84

食道:9.25

胃:9.35

腸:9.35

結腸:9.09

肝臓:8.68

肺:9.45

膀胱:-

腎臓:9.37

下垂体:9.41

甲状腺:9.80

副腎:9.41

膵臓:9.12

乳腺:9.72

唾液腺:9.21

CAGE

子宮:5.80

胎盤:5.70

前立腺:5.88

卵巣:6.15

精巣:5.76

心臓:5.71

骨格筋:5.61

食道:5.74

胃:-

腸:5.72

結腸:5.52

肝臓:5.62

肺:5.71

膀胱:5.88

腎臓:5.74

下垂体:5.69

甲状腺:5.70

副腎:-

膵臓:5.53

乳腺:5.62

唾液腺:5.16

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:5.33

卵巣:6.46

精巣:6.13

心臓:4.46

骨格筋:5.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:5.62

肝臓:4.22

肺:4.66

膀胱:-

腎臓:5.43

下垂体:-

甲状腺:6.06

副腎:5.60

膵臓:-

乳腺:5.38

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_004501
Gene ID	3192
Unigene ID	Hs.106212
Probe set ID	200594_x_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000153187
GTEx ID	ENSG00000153187

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]	NM_016805
ラット [0]

染色体

1q44 [245,014,468 - 245,027,844]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001870	B302 (SPRY)-like
IPR003877	SPla/RYanodine receptor SPRY
IPR018355	SPla/RYanodine receptor subgroup

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0070934	CRD-mediated mRNA stabilization
GO:0010467	gene expression
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0006396	RNA processing
GO:0008380	RNA splicing

Cellular Component

GO:0071013	catalytic step 2 spliceosome
GO:0009986	cell surface
GO:0070937	CRD-mediated mRNA stability complex
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0030529	ribonucleoprotein complex

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding

heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U (scaffold attachment factor A)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function