APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme) 1

同義遺伝子名

APEX1, APEX nuclease, REF-1 protein, APE, APEX, REF1, AP endonuclease 1, APX, REF-1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, APE1, APEN

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:129.20

小脳:214.10

脳幹:-

脳梁:58.30

松果体:445

末梢神経:-

脊柱:112.30

網膜:-

目:105.80

動脈:89.90

静脈:-

リンパ節:121.30

末梢血:164

脾臓:245.80

胸腺:38.70

骨髄:59

脂肪:161.30

骨:127.90

皮膚:225.60

GeneChip

大脳:8.14

小脳:8.10

脳幹:8.23

脳梁:8.10

松果体:-

末梢神経:8.37

脊柱:8.21

網膜:-

目:-

動脈:8.16

静脈:8.21

リンパ節:8.63

末梢血:-

脾臓:8.41

胸腺:9.07

骨髄:8.86

脂肪:8.62

骨:-

皮膚:8.76

CAGE

大脳:4.37

小脳:-

脳幹:4.37

脳梁:4.54

松果体:4.57

末梢神経:-

脊柱:4.44

網膜:-

目:-

動脈:4.20

静脈:4.64

リンパ節:4.65

末梢血:-

脾臓:4.78

胸腺:5.01

骨髄:-

脂肪:4.72

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.73

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.60

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.61

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:118.50

胎盤:262.30

前立腺:67.60

卵巣:37.30

精巣:30.30

心臓:242.70

骨格筋:60.30

食道:-

胃:212.40

腸:194.40

結腸:237.40

肝臓:52.80

肺:190.60

膀胱:125.60

腎臓:93.60

下垂体:116

甲状腺:-

副腎:304.70

膵臓:26.70

乳腺:130.10

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.93

胎盤:7.62

前立腺:8.73

卵巣:9.19

精巣:7.44

心臓:7.94

骨格筋:8.29

食道:8.47

胃:8.35

腸:8.54

結腸:8.64

肝臓:8.08

肺:8.08

膀胱:-

腎臓:8.39

下垂体:8.05

甲状腺:8.66

副腎:8.73

膵臓:8.70

乳腺:9.03

唾液腺:8.14

CAGE

子宮:4.71

胎盤:4.16

前立腺:4.52

卵巣:4.86

精巣:4.07

心臓:4.24

骨格筋:4.80

食道:4.59

胃:-

腸:4.48

結腸:4.56

肝臓:4.79

肺:4.38

膀胱:4.61

腎臓:4.64

下垂体:4.03

甲状腺:4.74

副腎:-

膵臓:4.47

乳腺:3.69

唾液腺:4.53

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.26

卵巣:4.52

精巣:3.04

心臓:2.82

骨格筋:1.23

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.46

肝臓:3.71

肺:0.00

膀胱:-

腎臓:1.54

下垂体:-

甲状腺:4.27

副腎:4.93

膵臓:-

乳腺:2.97

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_080648
Gene ID	328
Unigene ID	Hs.73722
Probe set ID	210027_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000100823
GTEx ID	ENSG00000100823

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]	NM_009687
ラット [0]

染色体

14q11.2 [20,923,350 - 20,925,927]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000097	AP endonuclease, family 1
IPR005135	Endonuclease/exonuclease/phosphatase
IPR004808	Exodeoxyribonuclease III xth

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007568	aging
GO:0006284	base-excision repair
GO:0045454	cell redox homeostasis
GO:0071320	cellular response to cAMP
GO:0070301	cellular response to hydrogen peroxide
GO:0071375	cellular response to peptide hormone stimulus
GO:0080111	DNA demethylation
GO:0006310	DNA recombination
GO:0006281	DNA repair
GO:0014912	negative regulation of smooth muscle cell migration
GO:0055114	oxidation reduction
GO:0045739	positive regulation of DNA repair
GO:0043488	regulation of mRNA stability
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0042493	response to drug
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005813	centrosome
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005783	endoplasmic reticulum
GO:0005739	mitochondrion
GO:0016607	nuclear speck
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0048471	perinuclear region of cytoplasm
GO:0005840	ribosome
GO:0005667	transcription factor complex

Molecular Function

GO:0008408	3'-5' exonuclease activity
GO:0031490	chromatin DNA binding
GO:0003684	damaged DNA binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0003906	DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase activity
GO:0004520	endodeoxyribonuclease activity
GO:0004519	endonuclease activity
GO:0046872	metal ion binding
GO:0051059	NF-kappaB binding
GO:0016491	oxidoreductase activity
GO:0004528	phosphodiesterase I activity
GO:0008081	phosphoric diester hydrolase activity
GO:0005515	protein binding
GO:0032403	protein complex binding
GO:0004523	ribonuclease H activity
GO:0003723	RNA binding
GO:0016890	site-specific endodeoxyribonuclease activity, specific for altered base
GO:0003713	transcription coactivator activity
GO:0003714	transcription corepressor activity
GO:0004844	uracil DNA N-glycosylase activity

APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme) 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function