heparan sulfate proteoglycan 2

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同義遺伝子名

SJA, SJS, HSPG, Perlecan, HSPG2, SJS1, heparan sulfate proteoglycan 2 (perlecan), PLC

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:19

小脳:-

脳幹:-

脳梁:145.80

松果体:-

末梢神経:368.10

脊柱:561.50

網膜:-

目:88.20

動脈:119.90

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:18.20

脾臓:75.60

胸腺:12.90

骨髄:19.70

脂肪:242

骨:127.90

皮膚:115.20

GeneChip

大脳:6.31

小脳:6.59

脳幹:6.27

脳梁:6.56

松果体:-

末梢神経:8.58

脊柱:6.27

網膜:-

目:-

動脈:9.82

静脈:9.35

リンパ節:7.98

末梢血:-

脾臓:8.27

胸腺:6.86

骨髄:6.58

脂肪:9.44

骨:-

皮膚:8.31

CAGE

大脳:1.67

小脳:-

脳幹:2.45

脳梁:2.58

松果体:2.88

末梢神経:-

脊柱:2.35

網膜:-

目:-

動脈:6.09

静脈:5.04

リンパ節:3.68

末梢血:-

脾臓:4.32

胸腺:2.73

骨髄:-

脂肪:5.55

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.59

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.66

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:5.81

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:154.90

胎盤:120.20

前立腺:135.20

卵巣:74.50

精巣:30.30

心臓:51.10

骨格筋:80.40

食道:-

胃:42.50

腸:-

結腸:178.10

肝臓:-

肺:97.80

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:-

甲状腺:655

副腎:-

膵臓:62.20

乳腺:65.10

唾液腺:-

GeneChip

子宮:9.02

胎盤:8.03

前立腺:8.19

卵巣:8.17

精巣:6.89

心臓:8.78

骨格筋:7.54

食道:8.08

胃:8.67

腸:8.56

結腸:8.58

肝臓:7.60

肺:8.24

膀胱:-

腎臓:7.92

下垂体:7.01

甲状腺:8.61

副腎:8.86

膵臓:7.32

乳腺:8.68

唾液腺:7.89

CAGE

子宮:5.54

胎盤:4.67

前立腺:5.09

卵巣:4.53

精巣:3.98

心臓:5.29

骨格筋:4.31

食道:5.04

胃:-

腸:4.16

結腸:5.05

肝臓:3.61

肺:4.33

膀胱:5.76

腎臓:4.27

下垂体:2.92

甲状腺:4.31

副腎:-

膵臓:3.78

乳腺:4.52

唾液腺:4.09

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.52

卵巣:3.58

精巣:4.15

心臓:3.73

骨格筋:2.44

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.59

肝臓:1.84

肺:3.31

膀胱:-

腎臓:3.34

下垂体:-

甲状腺:3.33

副腎:4.51

膵臓:-

乳腺:5.21

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_005529
Gene ID	3339
Unigene ID	Hs.562227
Probe set ID	201655_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000142798
GTEx ID	ENSG00000142798

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_008305
ラット[2]	NM_008305

染色体

1p36.12 [22,148,738 - 22,263,790]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR008985	Concanavalin A-like lectin/glucanase
IPR013320	Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup
IPR001881	EGF-like calcium-binding
IPR000742	EGF-like, type 3
IPR013106	Immunoglobulin V-set
IPR003596	Immunoglobulin V-set, subgroup
IPR000034	Laminin B type IV
IPR018031	Laminin B, subgroup
IPR001791	Laminin G

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0001525	angiogenesis
GO:0007420	brain development
GO:0005975	carbohydrate metabolic process
GO:0048738	cardiac muscle tissue development
GO:0060351	cartilage development involved in endochondral bone morphogenesis
GO:0002062	chondrocyte differentiation
GO:0030204	chondroitin sulfate metabolic process
GO:0048704	embryonic skeletal system morphogenesis
GO:0001958	endochondral ossification
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0006024	glycosaminoglycan biosynthetic process
GO:0006027	glycosaminoglycan catabolic process
GO:0030203	glycosaminoglycan metabolic process
GO:0042157	lipoprotein metabolic process
GO:0007603	phototransduction, visible light
GO:0008104	protein localization
GO:0001523	retinoid metabolic process

Cellular Component

GO:0005605	basal lamina
GO:0031012	extracellular matrix
GO:0005576	extracellular region
GO:0005615	extracellular space
GO:0070062	extracellular vesicular exosome
GO:0005796	Golgi lumen
GO:0043202	lysosomal lumen
GO:0005886	plasma membrane

Molecular Function

GO:0046872	metal ion binding
GO:0005515	protein binding
GO:0008022	protein C-terminus binding

heparan sulfate proteoglycan 2

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function