collagen, type XXVIII, alpha 1

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同義遺伝子名

COL28A1, collagen, type XXVIII, alpha 1, COL28

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:2.40 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:92 脊柱:224.60 網膜:- 目:29.40 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:4.80
GeneChip nodata
CAGE 大脳:0.01 小脳:- 脳幹:1.23 脳梁:0.24 松果体:1.18 末梢神経:- 脊柱:1.88 網膜:- 目:- 動脈:0.95 静脈:1.83 リンパ節:0.44 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:0 骨髄:- 脂肪:1.07 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.32 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.02 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.87 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:18.20 前立腺:22.50 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:8.50     肝臓:-        肺:9.80    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:9.30 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:1.70 胎盤:0 前立腺:1.59 卵巣:1.00 精巣:0.61 心臓:2.00 骨格筋:0.88 食道:2.44 胃:- 腸:1.66 結腸:2.09     肝臓:0.63    肺:0 膀胱:1.89 腎臓:0.15 下垂体:0 甲状腺:0.60 副腎:- 膵臓:0.94 乳腺:0.55 唾液腺:1.49
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.93 卵巣:0.91 精巣:0.97 心臓:1.21 骨格筋:0.62 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.44     肝臓:0.36        肺:0.77    膀胱:- 腎臓:1.04 下垂体:- 甲状腺:0.34 副腎:0.16 膵臓:- 乳腺:0.19 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001037763
Gene ID 340267
Unigene ID Hs.491104
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000215018
GTEx ID ENSG00000215018

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_001037865
ラット[1]  NM_001037865

染色体

7p21.3  [7,395,834  -  7,575,484]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

12477932
12690205
16330543
19913121
20379614
20628086
20889312
22610502

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007155  cell adhesion
GO:0030198  extracellular matrix organization

Cellular Component

GO:0005604  basement membrane
GO:0005581  collagen
GO:0005788  endoplasmic reticulum lumen
GO:0005576  extracellular region

Molecular Function

GO:0004867  serine-type endopeptidase inhibitor activity