shroom family member 2

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同義遺伝子名

FLJ39277, Apical-like protein, HSAPXL, shroom family member 2, APXL, apical protein-like (Xenopus laevis), DKFZp781J074, Protein APXL, SHROOM2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:41.50 小脳:25.20 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:64.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:12.80 皮膚:19.20
GeneChip 大脳:6.63 小脳:6.22 脳幹:6.32 脳梁:6.21 松果体:- 末梢神経:6.24 脊柱:6.61 網膜:- 目:- 動脈:5.49 静脈:5.68 リンパ節:5.53 末梢血:- 脾臓:5.36 胸腺:5.82 骨髄:5.21 脂肪:5.50 骨:- 皮膚:5.79
CAGE 大脳:2.43 小脳:- 脳幹:2.16 脳梁:2.29 松果体:0.83 末梢神経:- 脊柱:2.55 網膜:- 目:- 動脈:1.28 静脈:1.29 リンパ節:1.41 末梢血:- 脾臓:1.09 胸腺:1.47 骨髄:- 脂肪:0.96 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.44 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.37 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.40 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:29.10 前立腺:45.10 卵巣:- 精巣:43.30 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:8.50     肝臓:-        肺:14.70    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:27.90 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.85 胎盤:6.50 前立腺:7.19 卵巣:6.38 精巣:6.46 心臓:5.01 骨格筋:5.08 食道:6.48 胃:5.63 腸:5.44 結腸:5.64 肝臓:6.22 肺:6.69 膀胱:- 腎臓:6.36 下垂体:6.75 甲状腺:5.79 副腎:6.06 膵臓:5.85 乳腺:5.89 唾液腺:6
CAGE 子宮:1.93 胎盤:2.78 前立腺:2.37 卵巣:2.46 精巣:1.66 心臓:1.05 骨格筋:0.21 食道:2.10 胃:- 腸:1.13 結腸:1.62     肝臓:2.20    肺:2.76 膀胱:1.38 腎臓:2.14 下垂体:2.06 甲状腺:1.42 副腎:- 膵臓:1.87 乳腺:1.53 唾液腺:1.82
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.15 卵巣:1.98 精巣:3.19 心臓:0.19 骨格筋:0.12 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.56     肝臓:1.31        肺:1.40    膀胱:- 腎臓:1.48 下垂体:- 甲状腺:0.74 副腎:0.55 膵臓:- 乳腺:0.32 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001649
Gene ID 357
Unigene ID Hs.567236
Probe set ID 204967_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000146950
GTEx ID ENSG00000146950

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_172441
ラット[1]  NM_001047893

染色体

Xp22.2  [9,754,496  -  9,917,483]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7795590
12477932
14702039
15324660
15772651
16615870
16684770
17081983
17474147
17979178
19056867
21248203
22634755
23535732

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0051017  actin filament bundle formation
GO:0045176  apical protein localization
GO:0007420  brain development
GO:0043010  camera-type eye development
GO:0048593  camera-type eye morphogenesis
GO:0016477  cell migration
GO:0000902  cell morphogenesis
GO:0045217  cell-cell junction maintenance
GO:0043482  cellular pigment accumulation
GO:0043583  ear development
GO:0032401  establishment of melanosome localization
GO:0008057  eye pigment granule organization
GO:0002089  lens morphogenesis in camera-type eye
GO:0032438  melanosome organization
GO:0030835  negative regulation of actin filament depolymerization

Cellular Component

GO:0016324  apical plasma membrane
GO:0043025  cell soma
GO:0005913  cell-cell adherens junction
GO:0030864  cortical actin cytoskeleton
GO:0005856  cytoskeleton
GO:0031941  filamentous actin
GO:0005874  microtubule
GO:0005886  plasma membrane
GO:0005923  tight junction

Molecular Function

GO:0003779  actin binding
GO:0051015  actin filament binding
GO:0015280  amiloride-sensitive sodium channel activity
GO:0008013  beta-catenin binding
GO:0005515  protein binding
GO:0019904  protein domain specific binding