agrin

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同義遺伝子名

agrin, Agrin precursor, FLJ45064, AGRN, AGRIN

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:40.30 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:112.30 網膜:- 目:223.30 動脈:60 静脈:- リンパ節:40.40 末梢血:- 脾臓:37.80 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:12.80 皮膚:148.80
GeneChip 大脳:7.49 小脳:6.61 脳幹:6.92 脳梁:7.91 松果体:- 末梢神経:8.05 脊柱:7.33 網膜:- 目:- 動脈:7.37 静脈:6.91 リンパ節:6.95 末梢血:- 脾臓:6.97 胸腺:6.74 骨髄:6.15 脂肪:7.26 骨:- 皮膚:6.94
CAGE 大脳:2.43 小脳:- 脳幹:2.94 脳梁:3.63 松果体:1.66 末梢神経:- 脊柱:2.51 網膜:- 目:- 動脈:2.65 静脈:2.39 リンパ節:2.09 末梢血:- 脾臓:2.06 胸腺:2.38 骨髄:- 脂肪:2.03 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.06 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.79 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.55 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:63.80 胎盤:40.10 前立腺:56.30 卵巣:- 精巣:13 心臓:76.60 骨格筋:- 食道:- 胃:106.20 腸:- 結腸:67.80     肝臓:10.60        肺:102.60    膀胱:- 腎臓:72.80 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:17.80 乳腺:92.90 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.57 胎盤:6.80 前立腺:7.14 卵巣:7.47 精巣:7.27 心臓:6.94 骨格筋:6.57 食道:7.34 胃:7.47 腸:7.31 結腸:7.25 肝臓:7.47 肺:8.32 膀胱:- 腎臓:8.81 下垂体:6.95 甲状腺:8.58 副腎:6.45 膵臓:7.51 乳腺:8.30 唾液腺:7.72
CAGE 子宮:2.95 胎盤:2.95 前立腺:2.88 卵巣:2.70 精巣:2.76 心臓:2.62 骨格筋:1.11 食道:2.87 胃:- 腸:2.79 結腸:2.91     肝臓:2.70    肺:3.59 膀胱:2.40 腎臓:4.11 下垂体:1.39 甲状腺:3.79 副腎:- 膵臓:3.32 乳腺:2.53 唾液腺:3.40
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.54 卵巣:2.75 精巣:2.44 心臓:1.38 骨格筋:0.43 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.65     肝臓:2.01        肺:2.86    膀胱:- 腎臓:3.98 下垂体:- 甲状腺:3.71 副腎:2.29 膵臓:- 乳腺:2.91 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_198576
Gene ID 375790
Unigene ID Hs.273330
Probe set ID 212285_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000188157
GTEx ID ENSG00000188157

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_021604
ラット[1]  NM_175754

染色体

1p36.33  [955,503  -  991,496]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR004850  Agrin NtA
IPR008985  Concanavalin A-like lectin/glucanase
IPR013320  Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup
IPR001881  EGF-like calcium-binding
IPR000742  EGF-like, type 3
IPR003645  Follistatin-like, N-terminal
IPR001791  Laminin G
IPR002350  Proteinase inhibitor I1, Kazal
IPR008993  TIMP-like, OB-fold

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1326608
1659950
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19194276
19199708
19598235
19631309
19940118
20301347
20471664
21078624
21139048
22205389
22307776
22423096
23000965

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007411  axon guidance
GO:0005975  carbohydrate metabolic process
GO:0030204  chondroitin sulfate metabolic process
GO:0045162  clustering of voltage-gated sodium channels
GO:0030198  extracellular matrix organization
GO:0006024  glycosaminoglycan biosynthetic process
GO:0006027  glycosaminoglycan catabolic process
GO:0030203  glycosaminoglycan metabolic process
GO:0007213  muscarinic acetylcholine receptor signaling pathway
GO:0007603  phototransduction, visible light
GO:0051491  positive regulation of filopodium assembly
GO:0032321  positive regulation of Rho GTPase activity
GO:0045887  positive regulation of synaptic growth at neuromuscular junction
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0043113  receptor clustering
GO:0001523  retinoid metabolic process
GO:0007165  signal transduction
GO:0050808  synapse organization

Cellular Component

GO:0005605  basal lamina
GO:0030054  cell junction
GO:0031012  extracellular matrix
GO:0005576  extracellular region
GO:0005796  Golgi lumen
GO:0016021  integral to membrane
GO:0043202  lysosomal lumen
GO:0005886  plasma membrane
GO:0045202  synapse

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding
GO:0043395  heparan sulfate proteoglycan binding
GO:0043236  laminin binding
GO:0005515  protein binding
GO:0033691  sialic acid binding
GO:0005200  structural constituent of cytoskeleton