potassium intermediate/small conductance calcium-activated channel, subfamily N, member 2

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同義遺伝子名

KCa2.2, KCNN2, SKCA2, SK2, hSK2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:11.90 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:5.90 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:12.80 皮膚:4.80
GeneChip 大脳:5.35 小脳:5.67 脳幹:5.51 脳梁:5.63 松果体:- 末梢神経:5.51 脊柱:7.19 網膜:- 目:- 動脈:3.64 静脈:3.99 リンパ節:3.90 末梢血:- 脾臓:3.47 胸腺:3.33 骨髄:3.51 脂肪:3.59 骨:- 皮膚:3.65
CAGE 大脳:3.05 小脳:- 脳幹:2.65 脳梁:3.09 松果体:2.98 末梢神経:- 脊柱:2.75 網膜:- 目:- 動脈:0.59 静脈:0.34 リンパ節:0.62 末梢血:- 脾臓:0.76 胸腺:0.28 骨髄:- 脂肪:0.36 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.71 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.00 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:45.10 卵巣:- 精巣:8.70 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:101.60 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.17 胎盤:3.21 前立腺:7.11 卵巣:3.64 精巣:4.14 心臓:5.02 骨格筋:4.46 食道:3.72 胃:3.53 腸:3.64 結腸:3.63 肝臓:7.18 肺:3.85 膀胱:- 腎臓:4.05 下垂体:5.97 甲状腺:3.28 副腎:7.74 膵臓:4.08 乳腺:3.48 唾液腺:3.48
CAGE 子宮:1.02 胎盤:0.24 前立腺:2.58 卵巣:0.52 精巣:1.72 心臓:1.41 骨格筋:0.09 食道:0.90 胃:- 腸:0.14 結腸:0.76     肝臓:2.31    肺:1.17 膀胱:1.32 腎臓:0.67 下垂体:3.64 甲状腺:0.28 副腎:- 膵臓:1.87 乳腺:0 唾液腺:0.62
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.80 卵巣:0.59 精巣:1.43 心臓:1.42 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.32     肝臓:1.76        肺:0.05    膀胱:- 腎臓:0.28 下垂体:- 甲状腺:0.05 副腎:0.61 膵臓:- 乳腺:0.07 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_170775
Gene ID 3781
Unigene ID Hs.98280
Probe set ID 220116_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000080709
GTEx ID ENSG00000080709

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_080465
ラット [0]  

染色体

5q22.3  [113,696,666  -  113,832,321]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR011996  Potassium channel, calcium-activated, SK, conserved region
IPR003931  Potassium channel, calcium-activated, SK, conserved region, subgroup

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10559207
10713270
10758170
10991935
11146124
11323678
11395478
11527975
12477932
12778407
13679367
14702039
15362045
16382103
16396931
17110593
17452806
19139040
19815520
20972266
21906983
22154908
23251661
23525437
23602568
23677057

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006813  potassium ion transport
GO:0007268  synaptic transmission

Cellular Component

GO:0016021  integral to membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0051393  alpha-actinin binding
GO:0015269  calcium-activated potassium channel activity
GO:0005516  calmodulin binding
GO:0042803  protein homodimerization activity
GO:0016286  small conductance calcium-activated potassium channel activity