lipocalin 2

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同義遺伝子名

Lipocalin-2, LCN2, Oncogene 24p3, HNL, lipocalin 2 (oncogene 24p3), NGAL

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:1.20

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:47

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:255.10

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:1023.40

脂肪:-

骨:25.60

皮膚:86.40

GeneChip

大脳:4.81

小脳:4.47

脳幹:5.02

脳梁:4.44

松果体:-

末梢神経:4.46

脊柱:4.73

網膜:-

目:-

動脈:4.80

静脈:4.95

リンパ節:6.72

末梢血:-

脾臓:4.78

胸腺:5.76

骨髄:11.67

脂肪:5.41

骨:-

皮膚:6.89

CAGE

大脳:0.41

小脳:-

脳幹:0.42

脳梁:1.68

松果体:0.72

末梢神経:-

脊柱:0.30

網膜:-

目:-

動脈:4.88

静脈:2.13

リンパ節:3.56

末梢血:-

脾臓:3.47

胸腺:3.02

骨髄:-

脂肪:0.46

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.35

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.38

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.80

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:9.10

胎盤:3.60

前立腺:112.60

卵巣:37.30

精巣:-

心臓:-

骨格筋:-

食道:342.80

胃:318.60

腸:-

結腸:186.60

肝臓:-

肺:58.70

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:44.50

乳腺:37.20

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.06

胎盤:4.21

前立腺:5.88

卵巣:5.97

精巣:4.60

心臓:5.10

骨格筋:4.91

食道:9.65

胃:8.35

腸:6.79

結腸:7.57

肝臓:5.20

肺:6.69

膀胱:-

腎臓:5

下垂体:5.17

甲状腺:4.90

副腎:4.55

膵臓:6.20

乳腺:5.66

唾液腺:8.42

CAGE

子宮:4.88

胎盤:3.46

前立腺:4.46

卵巣:3.49

精巣:2.13

心臓:2.66

骨格筋:1.72

食道:5.86

胃:-

腸:2.61

結腸:3.55

肝臓:3.97

肺:5.25

膀胱:3.26

腎臓:4.07

下垂体:3.13

甲状腺:2.89

副腎:-

膵臓:4.31

乳腺:2.64

唾液腺:6.20

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.95

卵巣:4.13

精巣:5.50

心臓:0.01

骨格筋:0

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.51

肝臓:4.85

肺:6.97

膀胱:-

腎臓:4.44

下垂体:-

甲状腺:1.28

副腎:0.13

膵臓:-

乳腺:1.93

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_005564
Gene ID	3934
Unigene ID	Hs.204238
Probe set ID	212531_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000148346
GTEx ID	ENSG00000148346

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_008491
ラット [0]

染色体

9q34.11 [130,911,350 - 130,915,734]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002968	Alpha-1-microglobulin
IPR012674	Calycin
IPR011038	Calycin-like
IPR002345	Lipocalin
IPR000566	Lipocalin/cytosolic fatty-acid binding protein
IPR003087	Neutrophil gelatinase-associated lipocalin
IPR002972	Prostaglandin D synthase

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006915	apoptosis
GO:0070301	cellular response to hydrogen peroxide
GO:0071347	cellular response to interleukin-1
GO:0071222	cellular response to lipopolysaccharide
GO:0031669	cellular response to nutrient levels
GO:0071356	cellular response to tumor necrosis factor
GO:0045087	innate immune response
GO:0006811	ion transport
GO:0031346	positive regulation of cell projection organization
GO:0010628	positive regulation of gene expression
GO:0070207	protein homotrimerization
GO:0042981	regulation of apoptosis
GO:0042493	response to drug
GO:0009635	response to herbicide
GO:0009615	response to virus
GO:0015891	siderophore transport

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0005576	extracellular region
GO:0005615	extracellular space

Molecular Function

GO:0005506	iron ion binding
GO:0002020	protease binding
GO:0042803	protein homodimerization activity
GO:0005215	transporter activity

lipocalin 2

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function