low density lipoprotein receptor

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

LDL receptor, Low-density lipoprotein receptor precursor, LDLR, FHC

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:93.60 小脳:113.30 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:224.60 網膜:- 目:11.80 動脈:89.90 静脈:999.70 リンパ節:182 末梢血:- 脾臓:18.90 胸腺:25.80 骨髄:19.70 脂肪:80.70 骨:51.20 皮膚:81.60
GeneChip 大脳:5.51 小脳:5.55 脳幹:5.70 脳梁:5.74 松果体:- 末梢神経:6.44 脊柱:6.09 網膜:- 目:- 動脈:6.33 静脈:6.65 リンパ節:5.57 末梢血:- 脾臓:5.36 胸腺:5.10 骨髄:5.33 脂肪:5.86 骨:- 皮膚:6.27
CAGE 大脳:2.67 小脳:- 脳幹:2.84 脳梁:3.65 松果体:1.62 末梢神経:- 脊柱:3.37 網膜:- 目:- 動脈:3.49 静脈:2.66 リンパ節:2.93 末梢血:- 脾臓:2.99 胸腺:1.58 骨髄:- 脂肪:3.05 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.62 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.06 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:218.70 胎盤:76.50 前立腺:101.40 卵巣:149.10 精巣:64.90 心臓:38.30 骨格筋:40.20 食道:- 胃:148.70 腸:32.40 結腸:195     肝臓:168.90        肺:752.70    膀胱:- 腎臓:135.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:609.40 膵臓:80 乳腺:102.20 唾液腺:328.40
GeneChip 子宮:6.05 胎盤:5.48 前立腺:6.63 卵巣:6.31 精巣:5.22 心臓:6.01 骨格筋:5.47 食道:6.88 胃:6.18 腸:6.33 結腸:6.28 肝臓:6.03 肺:7.27 膀胱:- 腎臓:5.52 下垂体:5.19 甲状腺:5.23 副腎:7.74 膵臓:6.11 乳腺:5.96 唾液腺:5.77
CAGE 子宮:3.19 胎盤:2.97 前立腺:2.83 卵巣:4.46 精巣:2.64 心臓:3.14 骨格筋:1.99 食道:4.26 胃:- 腸:3.53 結腸:3.11     肝臓:3.67    肺:4.08 膀胱:3.35 腎臓:2.29 下垂体:2.14 甲状腺:2.04 副腎:- 膵臓:2.76 乳腺:3.84 唾液腺:2.80
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.08 卵巣:5.38 精巣:2.23 心臓:0.51 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.27     肝臓:2.38        肺:4.12    膀胱:- 腎臓:0.48 下垂体:- 甲状腺:0.43 副腎:3.06 膵臓:- 乳腺:1.05 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_000527
Gene ID 3949
Unigene ID Hs.213289
Probe set ID 202067_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000130164
GTEx ID ENSG00000130164

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_010700
ラット [0]  

染色体

19p13.2  [11,200,057  -  11,244,506]
LRG_274  [4,982  -  49,450]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001881  EGF-like calcium-binding
IPR000742  EGF-like, type 3

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

221835
226968
1301956
1446662
1464748
1609792
1634609
1734722
1757095
1833771
1867200
1978682
1999337
2318961
2352257
2544509
2569482
2570157
2726768
2760198
2760205
2777800
2805380
2831865
2837085
2855802
2901412
2920733
2988123
3005267
3012527
3020025
3104336
3198114
3263645
3343347
3549308
3627182
3815525
3866240
3924410
3955657
6091915
6129958
6291781
6299582
6326146
6327078
7550239
7573037
7578052
7581403
7583548
7603991
7635461
7635482
7649546
7649549
7718019
7822276
8096412
8141835
8168830
8182149
8300609
8347689
8462973
8555255
8626535
8664907
8740918
8889549
9016531
9026534
9104431
9143924
9222758
9254862
9259195
9262405
9265653
9555943
9654205
9678702
9733438
9744476
9788750
9837937
9852677
10090484
10206683
10330445
10380922
10391209
10422803
10447263
10571240
10660340
10827173
10832106
10882754
10884290
10906332
10933493
11050659
11100124
11149418
11157985
11173876
11194026
11247302
11257257
11298688
11317192
11317361
11332639
11453971
11462246
11524740
11668627
11668640
11702052
11737238
11848618
11849659
11851376
11857755
11860839
11916007
11923121
11923123
11933210
11947895
11986215
11997513
12002911
12009418
12031600
12036962
12042130
12048680
12052488
12055704
12072496
12082592
12113284
12121347
12149270
12165956
12169628
12189808
12209363
12221107
12235180
12414836
12417285
12442279
12459547
12464675
12473254
12473547
12477932
12485531
12492446
12493918
12522687
12544508
12551936
12562867
12615904
12671190
12705331
12716819
12730724
12746448
12754519
12810610
12820708
12873747
12898587
12901493
12944120
12947119
12969990
12975003
14508510
14550622
14557872
14568562
14615367
14616764
14624402
14739284
14746139
14756670
14967814
14993243
15015036
15068387
15100232
15133863
15135251
15144588
15166224
15172466
15241806
15286151
15321837
15321838
15321839
15359125
15477777
15489334
15526154
15546598
15556092
15585340
15592455
15630635
15637307
15665085
15677715
15689450
15701167
15741231
15754974
15795426
15797858
15823276
15823280
15823288
15842735
15863833
15864114
15888448
15890894
15899484
15931608
15936313
16014965
16015283
16020744
16092059
16129683
16159606
16179341
16183066
16205024
16257961
16259478
16286607
16289238
16335952
16341674
16344560
16378661
16389549
16459141
16465405
16596945
16608402
16627557
16650578
16741934
16750665
16770077
16792510
16796766
16806138
16806233
16809787
16825289
16828076
16837242
16870193
16907851
16920108
16927291
17044844
17079229
17090611
17094996
17142622
17156886
17170699
17196209
17223614
17234631
17239995
17273844
17277381
17328821
17335829
17347910
17399720
17435765
17445538
17452316
17461796
17473053
17517690
17531953
17539906
17566095
17607901
17625505
17706090
17709443
17766366
17784784
17784865
17855807
17889283
17898945
17905649
17935672
17964958
17988659
18006500
18028451
18065781
18097620
18193043
18193044
18206115
18210030
18243212
18247305
18261733
18288382
18296645
18307033
18317771
18331356
18343813
18354102
18355452
18369154
18376126
18400033
18513389
18622260
18635818
18660489
18660751
18669884
18676680
18677035
18685438
18701038
18714375
18718593
18757057
18799458
18847225
18851860
18936517
18940289
19007590
19020990
19056482
19060906
19060910
19060911
19062533
19073363
19081415
19081568
19087220
19131662
19141871
19148283
19148831
19170196
19196236
19198609
19208450
19222187
19224862
19263529
19318025
19319977
19322023
19336370
19336475
19361455
19367093
19371225
19411563
19467224
19479237
19491387
19520913
19533020
19538517
19578796
19583244
19589204
19625176
19656773
19667110
19674976
19692168
19706701
19717150
19729601
19751943
19773416
19811272
19843101
19887822
19888660
19906111
19913121
19936222
19946888
19948739
19948975
19956635
20019594
20030366
20031551
20045108
20049331
20059631
20065615
20089850
20129366
20129369
20144596
20145306
20163833
20167577
20172854
20217239
20232416
20236128
20308432
20371611
20403997
20413733
20416077
20428891
20452591
20485444
20498851
20506408
20506643
20536507
20538126
20565774
20571754
20599862
20602615
20615707
20628086
20628808
20634891
20663204
20679960
20686565
20691829
20702785
20703241
20714348
20734064
20738937
20810930
20864672
20962452
20971364
20972250
21115573
21139048
21149300
21294679
21345210
21377952
21378990
21418584
21418831
21457052
21461956
21462887
21473855
21511053
21538688
21606463
21685362
21692990
21722902
21734303
21757058
21763412
21765216
21775114
21777527
21829380
21872251
21876443
21909108
21909109
21925044
21935675
21943158
21947084
21963094
21988832
21990180
22003152
22010136
22024489
22059152
22074827
22081141
22091758
22109552
22128165
22129472
22153697
22160468
22190034
22257824
22275303
22278734
22286219
22311046
22323290
22353362
22378787
22388943
22390909
22417841
22425645
22487947
22509010
22544571
22554600
22597534
22621231
22698793
22716248
22826357
22848640
22875854
22910581
22916037
22968135
23021490
23022896
23105118
23135270
23155708
23162007
23297366
23333304
23369702
23380588
23382078
23400816
23509406
23510778
23535506
23564733
23588940
23589850
23593297
23669246
23675525
23726366
23733886
23746537
23754288
23788249
23957925
24025248
24042129
24046328
24097068
24103783
24144304
24158514
24225950
24257605
24262325
24338390
24352472
24404629
24447298
24450200
24486405
24530906
24632281
24640556

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0042632  cholesterol homeostasis
GO:0070508  cholesterol import
GO:0008203  cholesterol metabolic process
GO:0030301  cholesterol transport
GO:0006897  endocytosis
GO:0030299  intestinal cholesterol absorption
GO:0006629  lipid metabolic process
GO:0042157  lipoprotein metabolic process
GO:0034383  low-density lipoprotein particle clearance
GO:0015914  phospholipid transport
GO:0007603  phototransduction, visible light
GO:0010867  positive regulation of triglyceride biosynthetic process
GO:0006898  receptor-mediated endocytosis
GO:0010899  regulation of phosphatidylcholine catabolic process
GO:0001523  retinoid metabolic process
GO:0019048  virus-host interaction

Cellular Component

GO:0009986  cell surface
GO:0030669  clathrin-coated endocytic vesicle membrane
GO:0005905  coated pit
GO:0005769  early endosome
GO:0010008  endosome membrane
GO:0009897  external side of plasma membrane
GO:0005794  Golgi apparatus
GO:0005887  integral to plasma membrane
GO:0005770  late endosome
GO:0034362  low-density lipoprotein particle
GO:0005764  lysosome
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding
GO:0001948  glycoprotein binding
GO:0005041  low-density lipoprotein receptor activity
GO:0005515  protein binding
GO:0030229  very-low-density lipoprotein receptor activity