LIM homeobox 1

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同義遺伝子名

Homeobox protein Lim-1, LIM-1, LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, MGC126723, MGC138141, LIM homeobox 1, LIM homeobox protein 1, LIM1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:2.40 小脳:125.90 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:11.80 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:4.22 小脳:5.80 脳幹:4.59 脳梁:4.13 松果体:- 末梢神経:3.87 脊柱:4.05 網膜:- 目:- 動脈:4.14 静脈:4.51 リンパ節:4.09 末梢血:- 脾臓:3.92 胸腺:3.93 骨髄:4.16 脂肪:4.11 骨:- 皮膚:4.20
CAGE 大脳:0.56 小脳:- 脳幹:0.78 脳梁:0.07 松果体:0 末梢神経:- 脊柱:1.09 網膜:- 目:- 動脈:0.18 静脈:0 リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:0 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.06 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:- 前立腺:67.60 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:8.50     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:104 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.08 胎盤:4.11 前立腺:3.86 卵巣:4.37 精巣:3.91 心臓:4.19 骨格筋:4.45 食道:4.01 胃:3.92 腸:4.20 結腸:4.28 肝臓:4.12 肺:4.17 膀胱:- 腎臓:5.05 下垂体:3.93 甲状腺:3.97 副腎:3.97 膵臓:4.62 乳腺:3.94 唾液腺:4.18
CAGE 子宮:0.26 胎盤:0 前立腺:0.33 卵巣:0.56 精巣:0.19 心臓:0 骨格筋:0 食道:0 胃:- 腸:0 結腸:0     肝臓:0    肺:0 膀胱:0.09 腎臓:2.45 下垂体:0 甲状腺:0 副腎:- 膵臓:0 乳腺:0 唾液腺:0
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.38 卵巣:0.47 精巣:0.32 心臓:0 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0     肝臓:0        肺:0    膀胱:- 腎臓:2.72 下垂体:- 甲状腺:0 副腎:0 膵臓:- 乳腺:0.02 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_005568
Gene ID 3975
Unigene ID Hs.443727
Probe set ID 206230_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000132130
GTEx ID ENSG00000132130

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_008498
ラット [0]  

染色体

17q12  [35,294,772  -  35,301,912]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356  Homeobox
IPR009057  Homeodomain-like
IPR012287  Homeodomain-related

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7700351
8954926
9212161
9452425
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10623575
11882901
12438757
12477932
12642491
15489334
16022279
16625196
19615554
19849868
19889212
20797712
21132009
21778788
22217964
22231913
22740494
22875024
23954021

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0048646  anatomical structure formation involved in morphogenesis
GO:0009653  anatomical structure morphogenesis
GO:0009948  anterior/posterior axis specification
GO:0009952  anterior/posterior pattern formation
GO:0001658  branching involved in ureteric bud morphogenesis
GO:0007267  cell-cell signaling
GO:0021702  cerebellar Purkinje cell differentiation
GO:0021937  cerebellar Purkinje cell-granule cell precursor cell signaling involved in regulation of granule cell precursor cell proliferation
GO:0021549  cerebellum development
GO:0060067  cervix development
GO:0009953  dorsal/ventral pattern formation
GO:0001705  ectoderm formation
GO:0009880  embryonic pattern specification
GO:0060059  embryonic retina morphogenesis in camera-type eye
GO:0048703  embryonic viscerocranium morphogenesis
GO:0001706  endoderm formation
GO:0060429  epithelium development
GO:0060066  fallopian tube development
GO:0021871  forebrain regionalization
GO:0001702  gastrulation with mouth forming second
GO:0060322  head development
GO:0001822  kidney development
GO:0008045  motor axon guidance
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0007399  nervous system development
GO:0009887  organ morphogenesis
GO:0007389  pattern specification process
GO:0090190  positive regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis
GO:0040019  positive regulation of embryonic development
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0009791  post-embryonic development
GO:0090009  primitive streak formation
GO:0048793  pronephros development
GO:0010468  regulation of gene expression
GO:0010842  retina layer formation
GO:0032525  somite rostral/caudal axis specification
GO:0021527  spinal cord association neuron differentiation
GO:0021537  telencephalon development
GO:0006366  transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0001657  ureteric bud development
GO:0001655  urogenital system development
GO:0060065  uterus development
GO:0060068  vagina development
GO:0021517  ventral spinal cord development

Cellular Component

GO:0005634  nucleus
GO:0043234  protein complex

Molecular Function

GO:0043565  sequence-specific DNA binding
GO:0003714  transcription corepressor activity
GO:0003700  transcription factor activity
GO:0008270  zinc ion binding