ligase IV, DNA, ATP-dependent

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同義遺伝子名

ligase IV, DNA, ATP-dependent, DNA ligase 4, LIG4, Polydeoxyribonucleotide synthase [ATP] 4, DNA ligase IV

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:30.80

小脳:37.80

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:-

網膜:-

目:11.80

動脈:-

静脈:-

リンパ節:30.30

末梢血:18.20

脾臓:18.90

胸腺:64.40

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:19.20

GeneChip

大脳:4.89

小脳:5.12

脳幹:4.85

脳梁:4.81

松果体:-

末梢神経:4.28

脊柱:4.76

網膜:-

目:-

動脈:4.08

静脈:4.36

リンパ節:4

末梢血:-

脾臓:4.20

胸腺:6.62

骨髄:4.26

脂肪:4.18

骨:-

皮膚:4.14

CAGE

大脳:2.68

小脳:-

脳幹:2.92

脳梁:2.51

松果体:3.21

末梢神経:-

脊柱:2.74

網膜:-

目:-

動脈:1.33

静脈:1.92

リンパ節:1.58

末梢血:-

脾臓:2.55

胸腺:2.67

骨髄:-

脂肪:2.34

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.53

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.97

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.33

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:7.30

前立腺:11.30

卵巣:-

精巣:13

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:106.20

腸:-

結腸:-

肝臓:31.70

肺:14.70

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:116

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:27.90

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.35

胎盤:3.96

前立腺:4.23

卵巣:4.36

精巣:4.31

心臓:4.35

骨格筋:4.54

食道:4.14

胃:4.21

腸:4.44

結腸:4.21

肝臓:4.62

肺:4.19

膀胱:-

腎臓:4.10

下垂体:4.51

甲状腺:3.91

副腎:4.10

膵臓:4.13

乳腺:4.14

唾液腺:4.11

CAGE

子宮:1.68

胎盤:2.17

前立腺:2.11

卵巣:2.04

精巣:2.14

心臓:1.93

骨格筋:1.67

食道:2.21

胃:-

腸:2.26

結腸:1.41

肝臓:2.68

肺:1.92

膀胱:1.96

腎臓:2.46

下垂体:3.09

甲状腺:2.11

副腎:-

膵臓:0.94

乳腺:2.41

唾液腺:1.00

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.45

卵巣:0.42

精巣:0.83

心臓:1.43

骨格筋:1.52

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.85

肝臓:0.44

肺:1.40

膀胱:-

腎臓:0.46

下垂体:-

甲状腺:1.19

副腎:1.25

膵臓:-

乳腺:0.80

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_002312
Gene ID	3981
Unigene ID	Hs.166091
Probe set ID	206235_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000174405
GTEx ID	ENSG00000174405

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_176953
ラット [0]

染色体

13q33.3 [108,859,794 - 108,870,716]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

LRG_79 [5,753 - 13,093]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR012310

ATP dependent DNA ligase, central

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007049	cell cycle
GO:0051301	cell division
GO:0008283	cell proliferation
GO:0071285	cellular response to lithium ion
GO:0007417	central nervous system development
GO:0051276	chromosome organization
GO:0006266	DNA ligation
GO:0051102	DNA ligation during DNA recombination
GO:0051103	DNA ligation during DNA repair
GO:0006281	DNA repair
GO:0006302	double-strand break repair
GO:0006303	double-strand break repair via nonhomologous end joining
GO:0033152	immunoglobulin V(D)J recombination
GO:0001701	in utero embryonic development
GO:0045190	isotype switching
GO:0006273	lagging strand elongation
GO:0043524	negative regulation of neuron apoptosis
GO:0051402	neuron apoptosis
GO:0006297	nucleotide-excision repair, DNA gap filling
GO:0048146	positive regulation of fibroblast proliferation
GO:0050769	positive regulation of neurogenesis
GO:0002328	pro-B cell differentiation
GO:0010332	response to gamma radiation
GO:0010165	response to X-ray
GO:0000012	single strand break repair
GO:0035019	somatic stem cell maintenance
GO:0033077	T cell differentiation in the thymus
GO:0033153	T cell receptor V(D)J recombination
GO:0033151	V(D)J recombination
GO:0016032	viral reproduction

Cellular Component

GO:0000793	condensed chromosome
GO:0005737	cytoplasm
GO:0032807	DNA ligase IV complex
GO:0005958	DNA-dependent protein kinase-DNA ligase 4 complex
GO:0005925	focal adhesion
GO:0070419	nonhomologous end joining complex
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0005886	plasma membrane

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0003910	DNA ligase (ATP) activity
GO:0003909	DNA ligase activity
GO:0016874	ligase activity
GO:0046872	metal ion binding
GO:0005515	protein binding
GO:0008022	protein C-terminus binding

ligase IV, DNA, ATP-dependent

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function