lumican

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同義遺伝子名

LDC, Lumican precursor, KSPG lumican, Keratan sulfate proteoglycan lumican, lumican, SLRR2D, LUM

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:100.70

小脳:-

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:490.80

脊柱:224.60

網膜:-

目:170.40

動脈:119.90

静脈:1799.50

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:18.90

胸腺:90.20

骨髄:98.40

脂肪:847

骨:2303.10

皮膚:244.80

GeneChip

大脳:2.82

小脳:2.74

脳幹:2.78

脳梁:2.72

松果体:-

末梢神経:9.61

脊柱:3.21

網膜:-

目:-

動脈:9.52

静脈:10.10

リンパ節:8.83

末梢血:-

脾臓:4.49

胸腺:7.27

骨髄:4.51

脂肪:9.76

骨:-

皮膚:8.20

CAGE

大脳:0.93

小脳:-

脳幹:1.71

脳梁:1.78

松果体:3.25

末梢神経:-

脊柱:2.59

網膜:-

目:-

動脈:4.83

静脈:5.09

リンパ節:4.97

末梢血:-

脾臓:2.28

胸腺:2.39

骨髄:-

脂肪:5.85

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.76

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:7.90

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.99

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:1266.70

胎盤:1318.80

前立腺:112.60

卵巣:335.40

精巣:64.90

心臓:1021.70

骨格筋:241.10

食道:685.60

胃:594.80

腸:1393.10

結腸:144.20

肝臓:10.60

肺:591.40

膀胱:376.80

腎臓:207.90

下垂体:-

甲状腺:163.70

副腎:507.90

膵臓:71.10

乳腺:148.70

唾液腺:328.40

GeneChip

子宮:10.70

胎盤:10.17

前立腺:9.20

卵巣:9.56

精巣:5.99

心臓:9.57

骨格筋:6.25

食道:8.06

胃:9.46

腸:9.58

結腸:8.32

肝臓:6.33

肺:10.13

膀胱:-

腎臓:6.80

下垂体:5.28

甲状腺:8.47

副腎:9.93

膵臓:7.75

乳腺:9.47

唾液腺:5.68

CAGE

子宮:6.22

胎盤:7.80

前立腺:6.45

卵巣:6.31

精巣:4.42

心臓:5.63

骨格筋:2.37

食道:5.37

胃:-

腸:5.18

結腸:4.95

肝臓:3.76

肺:6.24

膀胱:6.21

腎臓:5.27

下垂体:2.69

甲状腺:4.85

副腎:-

膵臓:4.10

乳腺:4.93

唾液腺:3.45

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:7.82

卵巣:8.26

精巣:7.08

心臓:5.88

骨格筋:2.95

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:6.25

肝臓:3.39

肺:9.02

膀胱:-

腎臓:6.26

下垂体:-

甲状腺:5.48

副腎:6.12

膵臓:-

乳腺:6.98

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_002345
Gene ID	4060
Unigene ID	Hs.406475
Probe set ID	201744_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000139329
GTEx ID	ENSG00000139329

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_008524
ラット [0]

染色体

12q21.33 [91,496,406 - 91,505,608]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0005975	carbohydrate metabolic process
GO:0051216	cartilage development
GO:0030199	collagen fibril organization
GO:0030203	glycosaminoglycan metabolic process
GO:0018146	keratan sulfate biosynthetic process
GO:0042340	keratan sulfate catabolic process
GO:0042339	keratan sulfate metabolic process
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0070848	response to growth factor stimulus
GO:0014070	response to organic cyclic substance
GO:0007601	visual perception

Cellular Component

GO:0031012	extracellular matrix
GO:0005576	extracellular region
GO:0005615	extracellular space
GO:0005583	fibrillar collagen
GO:0005796	Golgi lumen
GO:0043202	lysosomal lumen
GO:0005578	proteinaceous extracellular matrix

Molecular Function

GO:0005518	collagen binding
GO:0005201	extracellular matrix structural constituent

lumican

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function