SMAD family member 5

同義遺伝子名

Mothers against decapentaplegic homolog 5, JV5-1, SMAD5, DKFZp781C1895, Smad5, Mothers against DPP homolog 5, Dwfc, DKFZp781O1323, Smad-5, MADH5, SMAD 5, hSmad5, SMAD-5, SMAD, mothers against DPP homolog 5 (Drosophila)

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:46.20

小脳:75.60

脳幹:-

脳梁:87.50

松果体:-

末梢神経:92

脊柱:-

網膜:-

目:17.60

動脈:119.90

静脈:-

リンパ節:91

末梢血:72.90

脾臓:18.90

胸腺:51.50

骨髄:19.70

脂肪:40.30

骨:89.60

皮膚:67.20

GeneChip

大脳:6.14

小脳:6.43

脳幹:6.24

脳梁:6.79

松果体:-

末梢神経:6.45

脊柱:6.50

網膜:-

目:-

動脈:5.89

静脈:6.79

リンパ節:6.56

末梢血:-

脾臓:7.08

胸腺:6.19

骨髄:6

脂肪:6.51

骨:-

皮膚:6.10

CAGE

大脳:3.69

小脳:-

脳幹:3.94

脳梁:4.06

松果体:4.00

末梢神経:-

脊柱:3.87

網膜:-

目:-

動脈:4.11

静脈:3.57

リンパ節:3.58

末梢血:-

脾臓:3.84

胸腺:3.07

骨髄:-

脂肪:4.19

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.00

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.00

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.00

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:118.50

胎盤:65.60

前立腺:56.30

卵巣:37.30

精巣:38.90

心臓:12.80

骨格筋:60.30

食道:342.80

胃:-

腸:97.20

結腸:42.40

肝臓:147.80

肺:73.30

膀胱:-

腎臓:93.60

下垂体:463.90

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:115.60

乳腺:18.60

唾液腺:328.40

GeneChip

子宮:7

胎盤:6.79

前立腺:6.60

卵巣:7.59

精巣:5.90

心臓:7.16

骨格筋:6.60

食道:6.43

胃:7.06

腸:6.89

結腸:6.77

肝臓:6.33

肺:6.89

膀胱:-

腎臓:6.76

下垂体:5.76

甲状腺:6.69

副腎:6.55

膵臓:6.48

乳腺:6.40

唾液腺:6.49

CAGE

子宮:4.52

胎盤:3.71

前立腺:4.25

卵巣:4.54

精巣:3.55

心臓:3.66

骨格筋:3.80

食道:4.07

胃:-

腸:3.48

結腸:3.68

肝臓:3.55

肺:3.67

膀胱:4.29

腎臓:3.76

下垂体:4.02

甲状腺:3.93

副腎:-

膵臓:3.61

乳腺:3.86

唾液腺:3.73

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.00

卵巣:0.40

精巣:0.17

心臓:0.00

骨格筋:0.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.00

肝臓:0.00

肺:0.00

膀胱:-

腎臓:0.00

下垂体:-

甲状腺:0.22

副腎:0.02

膵臓:-

乳腺:0.00

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001001419
Gene ID	4090
Unigene ID	Hs.167700
Probe set ID	205188_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000113658
GTEx ID	ENSG00000113658

オーソログ対応遺伝子

マウス [0]
ラット [0]

染色体

5q31.1 [135,468,534 - 135,524,435]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003619	MAD homology 1, Dwarfin-type
IPR013019	MAD homology, MH1
IPR001132	SMAD domain, Dwarfin-type
IPR017855	SMAD domain-like
IPR008984	SMAD/FHA domain

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0030509	BMP signaling pathway
GO:0060348	bone development
GO:0060048	cardiac muscle contraction
GO:0051216	cartilage development
GO:0071407	cellular response to organic cyclic substance
GO:0009880	embryonic pattern specification
GO:0030218	erythrocyte differentiation
GO:0007281	germ cell development
GO:0001880	Mullerian duct regression
GO:0002051	osteoblast fate commitment
GO:0045669	positive regulation of osteoblast differentiation
GO:0045893	positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006468	protein amino acid phosphorylation
GO:0007165	signal transduction
GO:0006351	transcription, DNA-dependent
GO:0007179	transforming growth factor beta receptor signaling pathway
GO:0001657	ureteric bud development

Cellular Component

GO:0005829	cytosol
GO:0016021	integral to membrane
GO:0005622	intracellular
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0005667	transcription factor complex

Molecular Function

GO:0046872	metal ion binding
GO:0005515	protein binding
GO:0005057	receptor signaling protein activity
GO:0003700	transcription factor activity
GO:0030618	transforming growth factor beta receptor, pathway-specific cytoplasmic mediator activity
GO:0031625	ubiquitin protein ligase binding

SMAD family member 5

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function