msh homeobox 2

同義遺伝子名

msh homeobox homolog 2 (Drosophila), FPP, CRS2, parietal foramina 1, msh (Drosophila) homeo box homolog 2, Homeobox protein MSX-2, Hox-8, MSH, HOX8, PFM, msh homeo box homolog 2 (Drosophila), MSX2

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:-

小脳:12.60

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:11.80

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:19.70

脂肪:-

骨:-

皮膚:9.60

GeneChip

大脳:3.84

小脳:3.96

脳幹:3.97

脳梁:3.74

松果体:-

末梢神経:3.85

脊柱:4.17

網膜:-

目:-

動脈:3.98

静脈:3.99

リンパ節:3.84

末梢血:-

脾臓:3.64

胸腺:3.59

骨髄:3.75

脂肪:4.03

骨:-

皮膚:4.18

CAGE

大脳:0.83

小脳:-

脳幹:1.07

脳梁:1.19

松果体:0.26

末梢神経:-

脊柱:2.41

網膜:-

目:-

動脈:0.59

静脈:0.47

リンパ節:0.22

末梢血:-

脾臓:0.92

胸腺:0

骨髄:-

脂肪:0.55

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.55

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.34

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.34

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:69.20

前立腺:-

卵巣:-

精巣:4.30

心臓:25.50

骨格筋:-

食道:-

胃:42.50

腸:-

結腸:17

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:9.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.51

胎盤:5.39

前立腺:4.01

卵巣:3.85

精巣:4.29

心臓:3.92

骨格筋:4.02

食道:3.72

胃:3.89

腸:3.93

結腸:3.79

肝臓:3.70

肺:3.80

膀胱:-

腎臓:3.78

下垂体:3.79

甲状腺:3.74

副腎:3.92

膵臓:4.38

乳腺:4.16

唾液腺:3.81

CAGE

子宮:1.35

胎盤:3.87

前立腺:2.14

卵巣:0.42

精巣:2.07

心臓:0.88

骨格筋:1.19

食道:0.77

胃:-

腸:0.53

結腸:0.61

肝臓:0

肺:0.40

膀胱:2.69

腎臓:0.33

下垂体:0.26

甲状腺:0.73

副腎:-

膵臓:0

乳腺:2.02

唾液腺:0

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.40

卵巣:0.23

精巣:2.04

心臓:0.55

骨格筋:0.88

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.30

肝臓:0.01

肺:0.28

膀胱:-

腎臓:0.40

下垂体:-

甲状腺:0.65

副腎:0.36

膵臓:-

乳腺:0.72

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_002449
Gene ID	4488
Unigene ID	Hs.89404
Probe set ID	205555_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000120149
GTEx ID	ENSG00000120149

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_013601
ラット [0]

染色体

5q35.2 [174,151,536 - 174,158,144]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356	Homeobox
IPR009057	Homeodomain-like
IPR012287	Homeodomain-related

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0042640	anagen
GO:0009952	anterior/posterior pattern formation
GO:0060346	bone trabecula formation
GO:0060444	branching involved in mammary gland duct morphogenesis
GO:0071392	cellular response to estradiol stimulus
GO:0071363	cellular response to growth factor stimulus
GO:0002063	chondrocyte development
GO:0060363	cranial suture morphogenesis
GO:0035115	embryonic forelimb morphogenesis
GO:0035116	embryonic hindlimb morphogenesis
GO:0070166	enamel mineralization
GO:0003416	endochondral bone growth
GO:0003198	epithelial to mesenchymal transition involved in endocardial cushion formation
GO:0060364	frontal suture morphogenesis
GO:0043066	negative regulation of apoptosis
GO:0008285	negative regulation of cell proliferation
GO:0032792	negative regulation of CREB transcription factor activity
GO:0045599	negative regulation of fat cell differentiation
GO:0045617	negative regulation of keratinocyte differentiation
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0002076	osteoblast development
GO:0001649	osteoblast differentiation
GO:0003148	outflow tract septum morphogenesis
GO:0043065	positive regulation of apoptosis
GO:0030513	positive regulation of BMP signaling pathway
GO:0051795	positive regulation of catagen
GO:0045669	positive regulation of osteoblast differentiation
GO:0035313	wound healing, spreading of epidermal cells

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0005667	transcription factor complex

Molecular Function

GO:0044212	DNA regulatory region binding
GO:0005515	protein binding
GO:0043565	sequence-specific DNA binding
GO:0003712	transcription cofactor activity
GO:0008134	transcription factor binding

msh homeobox 2

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function