myogenic differentiation 1

同義遺伝子名

myogenic factor 3, Myoblast determination protein 1, myogenic differentiation 1, MYOD, MYF3, PUM, MYOD1, Myogenic factor 3, Myf-3

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:-

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:5.90

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:40.30

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:5.38

小脳:5.46

脳幹:5.47

脳梁:5.30

松果体:-

末梢神経:5.07

脊柱:5.09

網膜:-

目:-

動脈:5.37

静脈:5.64

リンパ節:5.13

末梢血:-

脾臓:5.21

胸腺:5.05

骨髄:5.47

脂肪:5.30

骨:-

皮膚:5.29

CAGE

大脳:0.03

小脳:-

脳幹:0

脳梁:0

松果体:0

末梢神経:-

脊柱:0

網膜:-

目:-

動脈:0

静脈:0

リンパ節:0.17

末梢血:-

脾臓:0

胸腺:0

骨髄:-

脂肪:0.71

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.03

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.05

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:10.90

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:80.40

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.28

胎盤:5.29

前立腺:5.07

卵巣:5.28

精巣:5.20

心臓:5.37

骨格筋:6.36

食道:5.26

胃:5.23

腸:5.62

結腸:5.51

肝臓:5.31

肺:5.20

膀胱:-

腎臓:5.28

下垂体:5.27

甲状腺:5.01

副腎:5.18

膵臓:5.47

乳腺:5.07

唾液腺:5.23

CAGE

子宮:0.10

胎盤:0

前立腺:0

卵巣:0

精巣:0.22

心臓:0.03

骨格筋:2.54

食道:0.18

胃:-

腸:0

結腸:0

肝臓:0

肺:0

膀胱:0

腎臓:0

下垂体:0

甲状腺:0.12

副腎:-

膵臓:0

乳腺:0

唾液腺:0.36

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0

卵巣:0

精巣:0.38

心臓:0.03

骨格筋:1.79

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0

肝臓:0

肺:0

膀胱:-

腎臓:0

下垂体:-

甲状腺:0.96

副腎:0.01

膵臓:-

乳腺:0.13

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_002478
Gene ID	4654
Unigene ID	Hs.181768
Probe set ID	206657_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000129152
GTEx ID	ENSG00000129152

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_010866
ラット [0]

染色体

11p15.1 [17,741,115 - 17,743,678]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0055007	cardiac muscle cell differentiation
GO:0071385	cellular response to glucocorticoid stimulus
GO:0071453	cellular response to oxygen levels
GO:0009267	cellular response to starvation
GO:0042692	muscle cell differentiation
GO:0042693	muscle cell fate commitment
GO:0007517	muscle organ development
GO:0007518	myoblast cell fate determination
GO:0014904	myotube cell development
GO:0014908	myotube differentiation involved in skeletal muscle regeneration
GO:0051149	positive regulation of muscle cell differentiation
GO:0043415	positive regulation of skeletal muscle tissue regeneration
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006468	protein amino acid phosphorylation
GO:0000381	regulation of alternative nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0043484	regulation of RNA splicing
GO:0006357	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0043503	skeletal muscle fiber adaptation
GO:0048741	skeletal muscle fiber development
GO:0007519	skeletal muscle tissue development

Cellular Component

GO:0030016	myofibril
GO:0000790	nuclear chromatin
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0005667	transcription factor complex

Molecular Function

GO:0070888	E-box binding
GO:0005515	protein binding
GO:0046982	protein heterodimerization activity
GO:0003705	RNA polymerase II transcription factor activity, enhancer binding
GO:0003713	transcription coactivator activity
GO:0008134	transcription factor binding
GO:0031625	ubiquitin protein ligase binding

myogenic differentiation 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function