asparaginyl-tRNA synthetase

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同義遺伝子名

ASNS, ASNRS, asparaginyl-tRNA synthetase, Asparagine--tRNA ligase, AsnRS, Asparaginyl-tRNA synthetase, cytoplasmic, NARS

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:280.90 小脳:151.10 脳幹:- 脳梁:262.50 松果体:296.70 末梢神経:122.70 脊柱:112.30 網膜:- 目:82.30 動脈:359.70 静脈:- リンパ節:151.70 末梢血:218.60 脾臓:283.60 胸腺:193.30 骨髄:78.70 脂肪:121 骨:230.30 皮膚:153.60
GeneChip 大脳:9.51 小脳:9.38 脳幹:9.65 脳梁:8.97 松果体:- 末梢神経:9.24 脊柱:9.11 網膜:- 目:- 動脈:8.91 静脈:8.89 リンパ節:8.83 末梢血:- 脾臓:8.54 胸腺:8.93 骨髄:8.40 脂肪:8.83 骨:- 皮膚:9.09
CAGE 大脳:5.18 小脳:- 脳幹:5.24 脳梁:4.72 松果体:5.37 末梢神経:- 脊柱:5.41 網膜:- 目:- 動脈:4.51 静脈:4.42 リンパ節:4.43 末梢血:- 脾臓:4.70 胸腺:4.50 骨髄:- 脂肪:4.79 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:5.90 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:4.93 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:4.96 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:173.20 胎盤:76.50 前立腺:191.50 卵巣:111.80 精巣:69.20 心臓:153.30 骨格筋:40.20 食道:- 胃:254.90 腸:291.60 結腸:110.20     肝臓:221.70        肺:92.90    膀胱:125.60 腎臓:207.90 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:152.40 膵臓:80 乳腺:102.20 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.98 胎盤:8.27 前立腺:9.50 卵巣:9.21 精巣:8.13 心臓:8.96 骨格筋:9.09 食道:9.18 胃:9.01 腸:9.14 結腸:8.58 肝臓:8.64 肺:8.84 膀胱:- 腎臓:9.40 下垂体:8.95 甲状腺:9.29 副腎:9.18 膵臓:8.48 乳腺:9 唾液腺:8.90
CAGE 子宮:4.66 胎盤:4.52 前立腺:4.71 卵巣:4.85 精巣:4.28 心臓:5.02 骨格筋:5.41 食道:4.89 胃:- 腸:4.99 結腸:4.59     肝臓:5.03    肺:4.65 膀胱:5.01 腎臓:5.61 下垂体:5.09 甲状腺:5.02 副腎:- 膵臓:4.52 乳腺:4.81 唾液腺:4.82
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:5.56 卵巣:5.77 精巣:5.17 心臓:5.12 骨格筋:5.20 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:5.45     肝臓:4.96        肺:4.92    膀胱:- 腎臓:6.46 下垂体:- 甲状腺:6.07 副腎:5.25 膵臓:- 乳腺:5.32 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_004539
Gene ID 4677
Unigene ID Hs.465224
Probe set ID 200027_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000134440
GTEx ID ENSG00000134440

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]  NM_001142950, NM_027350
ラット[2]  NM_001025635, NM_001142949

染色体

18q21.31  [55,267,896  -  55,289,177]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR004364  Aminoacyl-tRNA synthetase, class II (D/K/N)
IPR018150  Aminoacyl-tRNA synthetase, class II (D/K/N)-like
IPR006195  Aminoacyl-tRNA synthetase, class II, conserved domain
IPR002312  Aspartyl-tRNA synthetase, class IIb

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

6836455
8125298
8619474
9110174
9421509
9801298
12477932
15231747
15489334
16196087
16713569
18029348
18781797
19056867
19738201
20877624
21139048
21890473
21906983
21963094
22174317
22586326
22863883
22939629
23000965
23752268
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006421  asparaginyl-tRNA aminoacylation
GO:0010467  gene expression
GO:0006418  tRNA aminoacylation for protein translation

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005829  cytosol
GO:0005739  mitochondrion

Molecular Function

GO:0004816  asparagine-tRNA ligase activity
GO:0005524  ATP binding
GO:0003676  nucleic acid binding