platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform Ib, subunit 1 (45kDa)

同義遺伝子名

LIS2, PAFAHA, PAFAH alpha, Lissencephaly-1 protein, PAFAH, PAFAH1B1, LIS-1, LIS1, PAF-AH 45 kDa subunit, PAF-AH alpha, PAF acetylhydrolase 45 kDa subunit

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:379.20

小脳:415.60

脳幹:-

脳梁:87.50

松果体:296.70

末梢神経:184

脊柱:336.90

網膜:118.60

目:217.40

動脈:119.90

静脈:133.30

リンパ節:80.90

末梢血:109.30

脾臓:113.40

胸腺:309.20

骨髄:78.70

脂肪:80.70

骨:76.80

皮膚:177.60

GeneChip

大脳:9.28

小脳:9.54

脳幹:9.29

脳梁:8.67

松果体:-

末梢神経:9.38

脊柱:8.78

網膜:-

目:-

動脈:8.02

静脈:7.90

リンパ節:7.87

末梢血:-

脾臓:7.98

胸腺:8.50

骨髄:7.08

脂肪:8.02

骨:-

皮膚:8.29

CAGE

大脳:4.77

小脳:-

脳幹:4.78

脳梁:4.44

松果体:4.55

末梢神経:-

脊柱:4.36

網膜:-

目:-

動脈:4.03

静脈:3.87

リンパ節:3.74

末梢血:-

脾臓:3.81

胸腺:4.35

骨髄:-

脂肪:3.90

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:6.23

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.42

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.53

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:200.50

胎盤:116.60

前立腺:169

卵巣:149.10

精巣:203.30

心臓:102.20

骨格筋:40.20

食道:-

胃:106.20

腸:64.80

結腸:144.20

肝臓:73.90

肺:195.50

膀胱:125.60

腎臓:93.60

下垂体:232

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:44.50

乳腺:102.20

唾液腺:656.80

GeneChip

子宮:8.46

胎盤:7.96

前立腺:8.37

卵巣:8.45

精巣:7.43

心臓:7.98

骨格筋:8.83

食道:8.10

胃:7.89

腸:7.91

結腸:7.12

肝臓:7.28

肺:8.16

膀胱:-

腎臓:7.77

下垂体:8.58

甲状腺:8.39

副腎:7.88

膵臓:6.43

乳腺:8.24

唾液腺:7.52

CAGE

子宮:4.12

胎盤:3.96

前立腺:3.93

卵巣:4.04

精巣:4.39

心臓:4.20

骨格筋:4.82

食道:4.06

胃:-

腸:4.26

結腸:3.99

肝臓:3.75

肺:4.23

膀胱:4.15

腎臓:3.91

下垂体:4.36

甲状腺:4.02

副腎:-

膵臓:3.52

乳腺:3.52

唾液腺:3.73

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.88

卵巣:5.30

精巣:5.39

心臓:5.02

骨格筋:5.21

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.82

肝臓:3.48

肺:4.31

膀胱:-

腎臓:4.92

下垂体:-

甲状腺:5.78

副腎:4.73

膵臓:-

乳腺:4.92

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000430
Gene ID	5048
Unigene ID	Hs.77318
Probe set ID	200816_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000007168
GTEx ID	ENSG00000007168

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]	NM_013625
ラット [0]

染色体

17p13.3 [2,496,923 - 2,588,909]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR020472	G-protein beta WD-40 repeat, region
IPR006594	LisH dimerisation motif
IPR001680	WD40 repeat
IPR019782	WD40 repeat 2
IPR019781	WD40 repeat, subgroup
IPR011046	WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986	WD40-repeat-containing domain
IPR015943	WD40/YVTN repeat-like-containing domain

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0001675	acrosome assembly
GO:0030036	actin cytoskeleton organization
GO:0008344	adult locomotory behavior
GO:0001667	ameboidal cell migration
GO:0048854	brain morphogenesis
GO:0021987	cerebral cortex development
GO:0021895	cerebral cortex neuron differentiation
GO:0021540	corpus callosum morphogenesis
GO:0051660	establishment of centrosome localization
GO:0000132	establishment of mitotic spindle orientation
GO:0000086	G2/M transition of mitotic cell cycle
GO:0021766	hippocampus development
GO:0021819	layer formation in the cerebral cortex
GO:0007611	learning or memory
GO:0016042	lipid catabolic process
GO:0000226	microtubule cytoskeleton organization
GO:0031023	microtubule organizing center organization
GO:0007017	microtubule-based process
GO:0007067	mitosis
GO:0000278	mitotic cell cycle
GO:0046329	negative regulation of JNK cascade
GO:0010977	negative regulation of neuron projection development
GO:0007405	neuroblast proliferation
GO:0050885	neuromuscular process controlling balance
GO:0001764	neuron migration
GO:0051081	nuclear envelope disassembly
GO:0007097	nuclear migration
GO:0046469	platelet activating factor metabolic process
GO:0045773	positive regulation of axon extension
GO:0001961	positive regulation of cytokine-mediated signaling pathway
GO:0045931	positive regulation of mitotic cell cycle
GO:0009306	protein secretion
GO:0032319	regulation of Rho GTPase activity
GO:0008090	retrograde axon cargo transport
GO:0017145	stem cell division
GO:0007268	synaptic transmission
GO:0019226	transmission of nerve impulse
GO:0047496	vesicle transport along microtubule

Cellular Component

GO:0000235	astral microtubule
GO:0005938	cell cortex
GO:0031252	cell leading edge
GO:0043025	cell soma
GO:0005813	centrosome
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0030426	growth cone
GO:0005871	kinesin complex
GO:0000776	kinetochore
GO:0005875	microtubule associated complex
GO:0031512	motile primary cilium
GO:0031513	nonmotile primary cilium
GO:0005635	nuclear envelope
GO:0031965	nuclear membrane
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus
GO:0048471	perinuclear region of cytoplasm
GO:0031982	vesicle

Molecular Function

GO:0034452	dynactin binding
GO:0045502	dynein binding
GO:0045505	dynein intermediate chain binding
GO:0008201	heparin binding
GO:0008017	microtubule binding
GO:0043274	phospholipase binding
GO:0051219	phosphoprotein binding
GO:0005515	protein binding
GO:0032403	protein complex binding
GO:0042803	protein homodimerization activity

platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform Ib, subunit 1 (45kDa)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function