Parkinson disease (autosomal recessive, juvenile) 2, parkin

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

PARK2, PDJ, Ubiquitin E3 ligase PRKN, Parkinson juvenile disease protein 2, Parkinson disease protein 2, PRKN, Parkin, LPRS2, AR-JP

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:52.10 小脳:75.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:148.30 末梢神経:61.30 脊柱:- 網膜:355.90 目:99.90 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:12.90 骨髄:98.40 脂肪:- 骨:12.80 皮膚:115.20
GeneChip 大脳:4.13 小脳:3.96 脳幹:4.10 脳梁:3.78 松果体:- 末梢神経:3.90 脊柱:3.92 網膜:- 目:- 動脈:3.76 静脈:3.97 リンパ節:3.74 末梢血:- 脾臓:3.58 胸腺:3.44 骨髄:3.72 脂肪:3.96 骨:- 皮膚:3.92
CAGE 大脳:2.88 小脳:- 脳幹:2.85 脳梁:2.91 松果体:2.93 末梢神経:- 脊柱:2.84 網膜:- 目:- 動脈:2.69 静脈:2.11 リンパ節:2.27 末梢血:- 脾臓:2.01 胸腺:1.43 骨髄:- 脂肪:2.71 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.41 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.22 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:27.30 胎盤:29.10 前立腺:90.10 卵巣:74.50 精巣:142.80 心臓:25.50 骨格筋:40.20 食道:- 胃:63.70 腸:- 結腸:50.90     肝臓:52.80        肺:34.20    膀胱:- 腎臓:41.60 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:26.70 乳腺:83.60 唾液腺:-
GeneChip 子宮:3.66 胎盤:3.75 前立腺:3.61 卵巣:3.75 精巣:3.92 心臓:4.17 骨格筋:4.25 食道:3.76 胃:3.68 腸:3.98 結腸:3.94 肝臓:3.78 肺:3.55 膀胱:- 腎臓:4.20 下垂体:3.80 甲状腺:3.66 副腎:3.82 膵臓:3.90 乳腺:3.59 唾液腺:3.92
CAGE 子宮:2.99 胎盤:1.05 前立腺:2.35 卵巣:2.44 精巣:3.20 心臓:2.92 骨格筋:2.93 食道:1.86 胃:- 腸:2.35 結腸:2.70     肝臓:1.51    肺:2.32 膀胱:2.08 腎臓:2.13 下垂体:2.94 甲状腺:1.57 副腎:- 膵臓:1.21 乳腺:2.34 唾液腺:2.57
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.17 卵巣:0.00 精巣:0.00 心臓:0.39 骨格筋:2.06 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.00     肝臓:0.00        肺:0.07    膀胱:- 腎臓:1.19 下垂体:- 甲状腺:0.44 副腎:0 膵臓:- 乳腺:0.00 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_013988
Gene ID 5071
Unigene ID Hs.132954
Probe set ID 207058_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000185345
GTEx ID ENSG00000185345

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_016694
ラット[1]  NM_020093

染色体

6q26  [161,768,452  -  163,148,803]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000626  Ubiquitin
IPR019956  Ubiquitin subgroup
IPR019955  Ubiquitin supergroup

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9014427
9042918
9560156
9570960
9634531
9731209
9802278
10072423
10214987
10319893
10511432
10791092
10824074
10888878
10939576
10965160
10973942
11009195
11078524
11163284
11179010
11215568
11241385
11248588
11278816
11402119
11405814
11431533
11439185
11468333
11487568
11527378
11588587
11590439
11679592
11839750
11889248
11971093
12000718
12034719
12044248
12112109
12114481
12116199
12138708
12150907
12165399
12270650
12362318
12364339
12374768
12397156
12477932
12548339
12548343
12584415
12628165
12629236
12634850
12670421
12673578
12676955
12691660
12692130
12707457
12716939
12719539
12730996
12764050
12781599
12783850
12784265
12815654
12891670
12925569
12928331
12963044
12972409
12972428
12973932
12975291
14519684
14532270
14559152
14574404
14579121
14614460
14639672
14645198
14678753
14727181
14737177
14962978
14976155
14987449
14991825
15078880
15090075
15101042
15102676
15105460
15108293
15132984
15192821
15198987
15229644
15252205
15261877
15266615
15300670
15315343
15326242
15453267
15455441
15456787
15489334
15492001
15525661
15557340
15584030
15603737
15606901
15632191
15642853
15717024
15718234
15728840
15737990
15781988
15823482
15862897
15894486
15896322
15944382
15963499
15970950
15987638
16019250
16049031
16086186
16096643
16130151
16135753
16157901
16169070
16189514
16215938
16227559
16227987
16244875
16269266
16287063
16332688
16339143
16344560
16352719
16367892
16391553
16449237
16455660
16476817
16500134
16502212
16511856
16517073
16606767
16636914
16637659
16643317
16672220
16714300
16720581
16734611
16769863
16793319
16819513
16826604
16837855
16840513
16862145
16905117
16914382
16955485
17017530
17068781
17097639
17187375
17207965
17267552
17280783
17285542
17314283
17324265
17327227
17329252
17335904
17353387
17400506
17415800
17465879
17467279
17512523
17553932
17599067
17680541
17682061
17687034
17722288
17724286
17766365
17846173
17873367
17883392
17934880
17935510
17976945
17989306
18003639
18004887
18022644
18068301
18188499
18195004
18211709
18248610
18248624
18331811
18335262
18362144
18378882
18387843
18413468
18464276
18486522
18514563
18519021
18519826
18541373
18554280
18560894
18561034
18644660
18671761
18704525
18759365
18784277
18785233
18845538
18927607
18936941
18942080
18951541
18957282
18973254
18973255
18987353
19006224
19013454
19029340
19036992
19038850
19043545
19050041
19060904
19067348
19087301
19146857
19162522
19167501
19205068
19224617
19228951
19229105
19240029
19279012
19285961
19297328
19330201
19339245
19351622
19358826
19377297
19405094
19473361
19475582
19483198
19491146
19526454
19585504
19610108
19615059
19617340
19617636
19628420
19631192
19636047
19651786
19663908
19672985
19679562
19692353
19715670
19716418
19723394
19726410
19734163
19741132
19801972
19822161
19863651
19875440
19880420
19909784
19913121
19946270
20031566
20034704
20043906
20089134
20089136
20098416
20146068
20153330
20171192
20182943
20188730
20301334
20301402
20301651
20379614
20399249
20404107
20424582
20450912
20483373
20506312
20508036
20547844
20558392
20571283
20573959
20604804
20628086
20629119
20630868
20643691
20652448
20686608
20696900
20798600
20800584
20810900
20823226
20842103
20854080
20871098
20876472
20885945
20889486
20889974
20890124
20940148
20969957
21113145
21131737
21147754
21173115
21177257
21187721
21205674
21209200
21215313
21221875
21292769
21296869
21322020
21348451
21360662
21376232
21408142
21466165
21500544
21532592
21534944
21535932
21568911
21584286
21590270
21615408
21625934
21635879
21640711
21663383
21694720
21753002
21816242
21856206
21865652
21900206
21915905
21930938
21993715
21996382
22008525
22009144
22011618
22028146
22057787
22078885
22080835
22081612
22082830
22095653
22200450
22233331
22271254
22287053
22302706
22308057
22314364
22350919
22354088
22361577
22377733
22388932
22396657
22431710
22445249
22488424
22511790
22517668
22555654
22724072
22766139
22773346
22777964
22792159
22813976
22910362
22927236
22939624
22954671
22956510
22993228
23010174
23052943
23060438
23068103
23125027
23212910
23225159
23256036
23258539
23275044
23313576
23319602
23345212
23350010
23382691
23392669
23393160
23436552
23447676
23459986
23470638
23503661
23531835
23535647
23555273
23608757
23616242
23644658
23670163
23707686
23727886
23737459
23751051
23767969
23770887
23770917
23852447
23861666
23933751
23986421
24005319
24013556
24023840
24063657
24063750
24079843
24149440
24149988
24167364
24190026
24231739
24244333
24250222
24298989
24328108
24423640
24446486
24660806
24722188
24751536
24784582
24790097

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0070842  aggresome assembly
GO:0008219  cell death
GO:0007417  central nervous system development
GO:0000422  mitochondrion degradation
GO:0032232  negative regulation of actin filament bundle formation
GO:0060548  negative regulation of cell death
GO:0043524  negative regulation of neuron apoptosis
GO:0001933  negative regulation of protein amino acid phosphorylation
GO:0090201  negative regulation of release of cytochrome c from mitochondria
GO:0070997  neuron death
GO:0043123  positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB cascade
GO:0051865  protein autoubiquitination
GO:0070936  protein K48-linked ubiquitination
GO:0070534  protein K63-linked ubiquitination
GO:0006513  protein monoubiquitination
GO:0000209  protein polyubiquitination
GO:0042787  protein ubiquitination during ubiquitin-dependent protein catabolic process
GO:0010506  regulation of autophagy
GO:0006511  ubiquitin-dependent protein catabolic process

Cellular Component

GO:0016235  aggresome
GO:0005737  cytoplasm
GO:0005829  cytosol
GO:0005783  endoplasmic reticulum
GO:0005794  Golgi apparatus
GO:0005739  mitochondrion
GO:0005634  nucleus
GO:0048471  perinuclear region of cytoplasm

Molecular Function

GO:0051087  chaperone binding
GO:0019900  kinase binding
GO:0030165  PDZ domain binding
GO:0005515  protein binding
GO:0019901  protein kinase binding
GO:0031625  ubiquitin protein ligase binding
GO:0004842  ubiquitin-protein ligase activity
GO:0008270  zinc ion binding