DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 41

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同義遺伝子名

DEAD box protein 41, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 41, DDX41, ABS, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, MGC8828, DEAD box protein abstrakt homolog

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:317.60 小脳:352.60 脳幹:- 脳梁:612.40 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:336.90 網膜:- 目:94 動脈:329.70 静脈:66.60 リンパ節:101.10 末梢血:382.60 脾臓:661.70 胸腺:463.80 骨髄:39.40 脂肪:80.70 骨:627 皮膚:100.80
GeneChip 大脳:7.13 小脳:6.70 脳幹:7.15 脳梁:6.43 松果体:- 末梢神経:6.72 脊柱:6.51 網膜:- 目:- 動脈:7.20 静脈:6.37 リンパ節:7.43 末梢血:- 脾臓:7.24 胸腺:7.22 骨髄:7.34 脂肪:7.02 骨:- 皮膚:7.37
CAGE 大脳:3.46 小脳:- 脳幹:3.32 脳梁:3.19 松果体:3.14 末梢神経:- 脊柱:2.97 網膜:- 目:- 動脈:3.00 静脈:3.27 リンパ節:3.43 末梢血:- 脾臓:3.39 胸腺:3.37 骨髄:- 脂肪:3.21 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:4.04 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:4.08 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.94 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:227.80 胎盤:189.40 前立腺:202.80 卵巣:111.80 精巣:168.70 心臓:76.60 骨格筋:- 食道:342.80 胃:21.20 腸:712.80 結腸:152.60     肝臓:63.30        肺:132    膀胱:376.80 腎臓:187.10 下垂体:- 甲状腺:327.50 副腎:406.30 膵臓:8.90 乳腺:74.30 唾液腺:328.40
GeneChip 子宮:7.05 胎盤:6.62 前立腺:7.27 卵巣:7.31 精巣:7.51 心臓:6.34 骨格筋:6.69 食道:7.25 胃:6.66 腸:6.83 結腸:7.01 肝臓:6.88 肺:7.05 膀胱:- 腎臓:7.02 下垂体:6.90 甲状腺:7.31 副腎:6.96 膵臓:6.17 乳腺:7.24 唾液腺:6.93
CAGE 子宮:3.24 胎盤:3.41 前立腺:3.23 卵巣:3.39 精巣:3.49 心臓:2.82 骨格筋:3.38 食道:3.48 胃:- 腸:3.27 結腸:2.97     肝臓:3.64    肺:3.07 膀胱:3.36 腎臓:3.54 下垂体:2.63 甲状腺:3.49 副腎:- 膵臓:3.02 乳腺:3.16 唾液腺:3.26
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:4.01 卵巣:4.43 精巣:4.57 心臓:2.30 骨格筋:3.39 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.68     肝臓:3.36        肺:3.29    膀胱:- 腎臓:3.97 下垂体:- 甲状腺:4.39 副腎:4.58 膵臓:- 乳腺:3.70 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_016222
Gene ID 51428
Unigene ID Hs.484288
Probe set ID 217840_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000183258
GTEx ID ENSG00000183258

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_134059
ラット[1]  NM_001108046

染色体

5q35.3  [176,938,578  -  176,944,470]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001  DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021  Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8125298
10607561
11991638
12477932
14702039
15302935
15489334
15635413
15690390
16565220
17081983
17353931
17474147
18029348
19615732
19946888
20360068
21139048
21145461
21209461
21252943
21890473
21892174
22365833
22797925
23142775
23752268
24250222
24778252

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006915  apoptosis
GO:0051607  defense response to virus
GO:0045087  innate immune response
GO:0007275  multicellular organismal development
GO:0000398  nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0032481  positive regulation of type I interferon production
GO:0032479  regulation of type I interferon production
GO:0006396  RNA processing

Cellular Component

GO:0071013  catalytic step 2 spliceosome
GO:0005829  cytosol
GO:0005783  endoplasmic reticulum
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0008026  ATP-dependent helicase activity
GO:0003677  DNA binding
GO:0003723  RNA binding
GO:0008270  zinc ion binding