Scm-like with four mbt domains 1

同義遺伝子名

SFMBT1, Renal ubiquitous protein 1, Scm-like with four mbt domains 1, Scm-like with four MBT domains protein 1, SFMBT, DKFZp434L243, RU1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:26.10

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:-

網膜:118.60

目:17.60

動脈:-

静脈:-

リンパ節:101.10

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:25.80

骨髄:-

脂肪:-

骨:25.60

皮膚:33.60

GeneChip

大脳:5.74

小脳:5.73

脳幹:5.76

脳梁:5.87

松果体:-

末梢神経:5.91

脊柱:5.77

網膜:-

目:-

動脈:5.95

静脈:6.07

リンパ節:6.63

末梢血:-

脾臓:6.20

胸腺:6.17

骨髄:6.37

脂肪:5.99

骨:-

皮膚:5.91

CAGE

大脳:2.19

小脳:-

脳幹:1.97

脳梁:2.21

松果体:3.27

末梢神経:-

脊柱:2.59

網膜:-

目:-

動脈:2.24

静脈:2.31

リンパ節:2.73

末梢血:-

脾臓:2.06

胸腺:2.10

骨髄:-

脂肪:1.76

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.16

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.00

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.43

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:9.10

胎盤:14.60

前立腺:11.30

卵巣:37.30

精巣:220.60

心臓:25.50

骨格筋:-

食道:-

胃:63.70

腸:-

結腸:17

肝臓:31.70

肺:9.80

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:26.70

乳腺:139.40

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.77

胎盤:6.01

前立腺:5.97

卵巣:5.84

精巣:8.65

心臓:6.11

骨格筋:6.50

食道:6.11

胃:6.09

腸:6.25

結腸:6.04

肝臓:6.08

肺:5.86

膀胱:-

腎臓:6.05

下垂体:6.36

甲状腺:6.25

副腎:5.81

膵臓:6.81

乳腺:6.08

唾液腺:6.37

CAGE

子宮:1.95

胎盤:1.96

前立腺:2.27

卵巣:1.44

精巣:3.98

心臓:2.66

骨格筋:2.98

食道:2.03

胃:-

腸:2.39

結腸:2.69

肝臓:2.19

肺:2.57

膀胱:1.92

腎臓:2.34

下垂体:2.95

甲状腺:2.05

副腎:-

膵臓:3.16

乳腺:2.87

唾液腺:2.46

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.01

卵巣:0.59

精巣:3.26

心臓:0.00

骨格筋:0.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.22

肝臓:0.00

肺:0.00

膀胱:-

腎臓:0.27

下垂体:-

甲状腺:0.00

副腎:0.55

膵臓:-

乳腺:0.00

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001005158
Gene ID	51460
Unigene ID	Hs.343679
Probe set ID	213370_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000163935
GTEx ID	ENSG00000163935

オーソログ対応遺伝子

マウス[12]	NM_001166531, NM_001166532, NM_019460
ラット [0]

染色体

3p21.1 [52,937,693 - 53,080,766]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001660	Sterile alpha motif
IPR010993	Sterile alpha motif homology
IPR013761	Sterile alpha motif-type

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0030154	cell differentiation
GO:0016568	chromatin modification
GO:0048635	negative regulation of muscle organ development
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0007283	spermatogenesis
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634

nucleus

Molecular Function

GO:0042393	histone binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003714	transcription corepressor activity

Scm-like with four mbt domains 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function